More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6433 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 642 aa  1327    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 593 aa  646    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 596 aa  629  1e-179  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 621 aa  621  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 592 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 599 aa  595  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 597 aa  594  1e-168  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 597 aa  583  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 592 aa  584  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 592 aa  542  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 590 aa  413  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  33.23 
 
 		 585 aa  326  9e-88  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 601 aa  239  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 635 aa  207  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 		 574 aa  206  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 565 aa  204  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 		 640 aa  203  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  26.02 
 
 		 624 aa  200  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 		 613 aa  193  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 591 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 		 563 aa  188  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  26.48 
 
 		 565 aa  187  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  24.33 
 
 		 564 aa  187  6e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  26.48 
 
 		 565 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  26.03 
 
 		 565 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 566 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 598 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 		 591 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 		 564 aa  176  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  25.12 
 
 		 566 aa  175  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  24.23 
 
 		 562 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1338  arginyl-tRNA synthetase  25.41 
 
 		 660 aa  174  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 		 562 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 		 562 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  24.24 
 
 		 562 aa  171  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 		 613 aa  171  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  24.13 
 
 		 562 aa  171  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  24.05 
 
 		 562 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 		 555 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  25.7 
 
 		 622 aa  169  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  24.05 
 
 		 562 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  24.06 
 
 		 562 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 563 aa  167  8e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  24.01 
 
 		 562 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  27.27 
 
 		 650 aa  164  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 590 aa  163  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 558 aa  163  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 575 aa  161  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  25.46 
 
 		 612 aa  161  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  24.47 
 
 		 566 aa  161  4e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  25.86 
 
 		 619 aa  160  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  24.3 
 
 		 569 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 576 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  24.19 
 
 		 595 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 630 aa  157  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 		 562 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  24.84 
 
 		 572 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  23.3 
 
 		 571 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 581 aa  157  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 567 aa  156  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  25.73 
 
 		 566 aa  156  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  26.16 
 
 		 558 aa  155  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  25.6 
 
 		 581 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  25.36 
 
 		 562 aa  155  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  23.5 
 
 		 585 aa  155  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  25.74 
 
 		 566 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  25.33 
 
 		 625 aa  153  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 		 635 aa  152  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  24.31 
 
 		 582 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  22.9 
 
 		 433 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4389  arginyl-tRNA synthetase  24.6 
 
 		 613 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  25.59 
 
 		 558 aa  151  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  25.22 
 
 		 577 aa  152  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  24.32 
 
 		 574 aa  151  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  25.74 
 
 		 577 aa  151  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  25.74 
 
 		 577 aa  151  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  25.3 
 
 		 581 aa  151  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  25.74 
 
 		 577 aa  151  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0542  arginyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 585 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 		 581 aa  151  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  25.74 
 
 		 577 aa  151  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 		 581 aa  150  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0525  arginyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 		 585 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  25.22 
 
 		 577 aa  150  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 		 550 aa  150  8e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5574  arginyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 		 619 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  0.593378 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  25.57 
 
 		 577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  25.82 
 
 		 630 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  25.57 
 
 		 577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2213  arginyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 		 588 aa  149  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  25.05 
 
 		 632 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3238  arginyl-tRNA synthetase  24.14 
 
 		 585 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  24.96 
 
 		 602 aa  148  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  25.23 
 
 		 581 aa  148  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  25.23 
 
 		 581 aa  148  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  25.92 
 
 		 581 aa  147  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  25.23 
 
 		 581 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  24.29 
 
 		 585 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  23.15 
 
 		 576 aa  147  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>