More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1715 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 		 625 aa  764    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 619 aa  1254    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 635 aa  422  1e-117  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 635 aa  370  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 632 aa  365  2e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 630 aa  361  2e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 630 aa  359  9.999999999999999e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 629 aa  354  2e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 558 aa  248  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 558 aa  239  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 		 574 aa  238  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24923  predicted protein  29.43 
 
 		 652 aa  236  9e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.321104  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 		 569 aa  234  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 555 aa  231  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 		 567 aa  226  7e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 555 aa  226  8e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 		 566 aa  226  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 566 aa  224  4e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 		 558 aa  223  8e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 566 aa  223  9e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 		 550 aa  222  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 559 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 566 aa  217  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 591 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 628 aa  200  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 613 aa  197  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 		 612 aa  195  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 583 aa  192  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  25.28 
 
 		 565 aa  190  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 		 565 aa  189  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 		 564 aa  189  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  24.96 
 
 		 563 aa  187  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 		 566 aa  186  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  24.96 
 
 		 565 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  24.39 
 
 		 563 aa  182  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 		 603 aa  175  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  26.53 
 
 		 593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  26.02 
 
 		 650 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  25.47 
 
 		 597 aa  175  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 628 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 601 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  25.15 
 
 		 585 aa  173  6.999999999999999e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 		 590 aa  173  9e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 		 562 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  24.39 
 
 		 563 aa  171  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  24.25 
 
 		 565 aa  171  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  25.86 
 
 		 596 aa  170  6e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  24.76 
 
 		 562 aa  170  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  25.35 
 
 		 561 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 		 562 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  24.39 
 
 		 562 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 		 562 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  25.28 
 
 		 562 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 		 562 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 		 562 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 		 621 aa  167  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  25.86 
 
 		 597 aa  167  5.9999999999999996e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 		 562 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 		 599 aa  166  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 		 571 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  24.33 
 
 		 564 aa  164  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 		 569 aa  163  7e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  23.71 
 
 		 562 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 557 aa  162  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0343  arginyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 577 aa  162  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  23.73 
 
 		 566 aa  162  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  25.56 
 
 		 576 aa  161  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 591 aa  161  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  25.86 
 
 		 642 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  24.88 
 
 		 577 aa  160  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0461  arginyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 561 aa  160  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185336  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0669  arginyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 565 aa  160  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  25.27 
 
 		 576 aa  159  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 		 576 aa  157  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  25.35 
 
 		 592 aa  156  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  25.49 
 
 		 562 aa  156  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  25.74 
 
 		 592 aa  156  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  25.24 
 
 		 576 aa  153  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  24.61 
 
 		 572 aa  152  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0153  arginyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 		 561 aa  153  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 592 aa  152  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 640 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 595 aa  150  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 568 aa  150  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3701  arginyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 		 558 aa  150  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  25.3 
 
 		 574 aa  150  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 		 546 aa  150  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  24.41 
 
 		 576 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 		 556 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  25.74 
 
 		 594 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  24.41 
 
 		 576 aa  148  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  23.27 
 
 		 624 aa  148  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  24.88 
 
 		 561 aa  148  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0145  arginyl-tRNA synthetase  25.42 
 
 		 596 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  24.73 
 
 		 599 aa  148  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 		 546 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  25.4 
 
 		 562 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  25.27 
 
 		 598 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 576 aa  147  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 		 592 aa  147  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>