More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0441 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  78.2 
 
 		 635 aa  986    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 629 aa  1270    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  75.95 
 
 		 630 aa  971    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  74.88 
 
 		 632 aa  981    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 630 aa  518  1.0000000000000001e-145  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 635 aa  424  1e-117  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 619 aa  354  2e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 625 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 567 aa  232  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 555 aa  226  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 566 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 		 569 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 612 aa  220  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 566 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 558 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 		 613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  30.68 
 
 		 566 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  30.74 
 
 		 558 aa  213  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 		 583 aa  210  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 591 aa  209  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 		 555 aa  207  7e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 559 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 558 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 		 574 aa  196  9e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  30.06 
 
 		 597 aa  196  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 		 592 aa  196  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 		 640 aa  194  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  26.13 
 
 		 566 aa  189  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 569 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 601 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 		 613 aa  179  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  26.24 
 
 		 565 aa  176  9e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 621 aa  176  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 574 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24923  predicted protein  27.2 
 
 		 652 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.321104  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 590 aa  174  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 565 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 		 597 aa  173  6.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 		 565 aa  171  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 628 aa  169  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 		 564 aa  168  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 628 aa  167  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 		 624 aa  167  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 		 595 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 		 599 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 565 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 		 550 aa  164  5.0000000000000005e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 		 592 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  26.02 
 
 		 563 aa  162  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 		 592 aa  160  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  25.84 
 
 		 563 aa  158  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 585 aa  158  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 		 572 aa  157  6e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 		 600 aa  157  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 591 aa  156  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  28.72 
 
 		 650 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 566 aa  155  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  27.09 
 
 		 590 aa  154  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 566 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 594 aa  152  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 		 579 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 594 aa  151  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 594 aa  151  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 603 aa  149  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 		 593 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 564 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 594 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 594 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 594 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 594 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 594 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  25.4 
 
 		 563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2032  arginyl-tRNA synthetase  25.57 
 
 		 647 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 		 577 aa  147  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 		 599 aa  147  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2831  arginyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 		 593 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 598 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  24.73 
 
 		 642 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 587 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 		 578 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  25.52 
 
 		 576 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0145  arginyl-tRNA synthetase  28.75 
 
 		 596 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 596 aa  144  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2968  arginyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 		 593 aa  143  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  25.8 
 
 		 577 aa  143  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  24.39 
 
 		 576 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 571 aa  143  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1110  arginyl-tRNA synthetase  25.82 
 
 		 582 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 		 594 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  24.69 
 
 		 589 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  25.8 
 
 		 577 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  25.8 
 
 		 577 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  25.8 
 
 		 577 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  25.8 
 
 		 577 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 		 577 aa  141  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  25.8 
 
 		 577 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  25.8 
 
 		 577 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  25.8 
 
 		 577 aa  141  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  24.51 
 
 		 589 aa  140  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0137  arginyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 596 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>