More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0153 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  57.12 
 
 		 568 aa  641    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0137  arginyl-tRNA synthetase  63.36 
 
 		 596 aa  714    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0287  arginyl-tRNA synthetase  64.03 
 
 		 600 aa  721    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  65.89 
 
 		 594 aa  727    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0145  arginyl-tRNA synthetase  63.36 
 
 		 596 aa  717    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  65.89 
 
 		 594 aa  727    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0414  arginyl-tRNA synthetase  69.6 
 
 		 569 aa  805    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.872884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0343  arginyl-tRNA synthetase  69.42 
 
 		 577 aa  795    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0127  arginyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 595 aa  730    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  76.51 
 
 		 561 aa  855    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  68.28 
 
 		 557 aa  757    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  65.89 
 
 		 594 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6262  arginyl-tRNA synthetase  66.84 
 
 		 593 aa  719    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3701  arginyl-tRNA synthetase  70.82 
 
 		 558 aa  808    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0669  arginyl-tRNA synthetase  68.37 
 
 		 565 aa  781    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  65.89 
 
 		 594 aa  724    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2934  arginyl-tRNA synthetase  67.02 
 
 		 593 aa  718    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  65.89 
 
 		 594 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0773  arginyl-tRNA synthetase  70.8 
 
 		 565 aa  811    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  65.89 
 
 		 594 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1686  arginyl-tRNA synthetase  60.41 
 
 		 575 aa  684    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 		 556 aa  670    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  72.42 
 
 		 561 aa  820    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4245  arginyl-tRNA synthetase  65.16 
 
 		 596 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  65.89 
 
 		 594 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2831  arginyl-tRNA synthetase  67.55 
 
 		 593 aa  726    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0473  arginyl-tRNA synthetase  65.66 
 
 		 596 aa  719    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0096  arginyl-tRNA synthetase  65.88 
 
 		 602 aa  750    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2305  arginyl-tRNA synthetase  67.02 
 
 		 593 aa  718    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0573  arginyl-tRNA synthetase  69.8 
 
 		 569 aa  780    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  65.89 
 
 		 594 aa  727    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0153  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 561 aa  1139    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1977  arginyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 575 aa  645    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2968  arginyl-tRNA synthetase  67.2 
 
 		 593 aa  721    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2919  arginyl-tRNA synthetase  67.02 
 
 		 593 aa  718    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  66.96 
 
 		 594 aa  744    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  67.32 
 
 		 598 aa  742    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0332  arginyl-tRNA synthetase  69.24 
 
 		 567 aa  794    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0461  arginyl-tRNA synthetase  70.8 
 
 		 561 aa  797    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185336  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 		 564 aa  627  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  57.06 
 
 		 561 aa  625  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 		 561 aa  627  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  57.54 
 
 		 569 aa  618  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  56.2 
 
 		 561 aa  611  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 562 aa  607  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 562 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 		 563 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 562 aa  597  1e-169  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 		 562 aa  597  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 587 aa  435  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 554 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 598 aa  433  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 553 aa  432  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 553 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 553 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 554 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 556 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 554 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 551 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 584 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 587 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 589 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 556 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 587 aa  415  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 586 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 556 aa  415  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 556 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 589 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 592 aa  413  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 556 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 556 aa  415  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 561 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 556 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 559 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 550 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 556 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 575 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 586 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 559 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 556 aa  402  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 550 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 563 aa  402  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 551 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 570 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 543 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 557 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 592 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 586 aa  398  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 583 aa  396  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 551 aa  398  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 553 aa  396  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2943  arginyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 583 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201497  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1588  arginyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 580 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.175533 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 560 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>