More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3387 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  54.25 
 
 		 994 aa  1087    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1015 aa  654    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  39.11 
 
 		 1016 aa  672    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  39.37 
 
 		 1018 aa  654    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  38.3 
 
 		 1015 aa  655    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  38.36 
 
 		 1015 aa  651    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  39.17 
 
 		 1023 aa  667    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  39.29 
 
 		 1049 aa  666    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  100 
 
 		 1003 aa  2061    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  37.25 
 
 		 978 aa  614  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  34.03 
 
 		 970 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  34.1 
 
 		 976 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  33.37 
 
 		 970 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  32.54 
 
 		 970 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  33.2 
 
 		 973 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  32.67 
 
 		 966 aa  439  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  34.33 
 
 		 910 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  32.27 
 
 		 973 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  31.7 
 
 		 975 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  32.77 
 
 		 981 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  31.69 
 
 		 974 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  31.51 
 
 		 977 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  31.64 
 
 		 967 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  41.9 
 
 		 976 aa  351  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  40.17 
 
 		 981 aa  329  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  40.17 
 
 		 981 aa  329  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  40 
 
 		 436 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  40.92 
 
 		 448 aa  303  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  40.8 
 
 		 427 aa  300  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  39.43 
 
 		 427 aa  296  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  36.4 
 
 		 458 aa  295  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  38.17 
 
 		 427 aa  295  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  39.75 
 
 		 427 aa  293  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  38.16 
 
 		 434 aa  293  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  40.28 
 
 		 443 aa  292  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  37.79 
 
 		 434 aa  291  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  39.67 
 
 		 433 aa  291  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  38.48 
 
 		 427 aa  286  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  37.33 
 
 		 446 aa  285  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  38.83 
 
 		 465 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  36.43 
 
 		 448 aa  281  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  36.28 
 
 		 448 aa  281  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  35.65 
 
 		 447 aa  280  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  39.48 
 
 		 416 aa  279  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  39.07 
 
 		 442 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  35.8 
 
 		 447 aa  275  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  36.83 
 
 		 424 aa  269  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  36.6 
 
 		 429 aa  265  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  36.69 
 
 		 413 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  36.3 
 
 		 436 aa  241  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  36.81 
 
 		 436 aa  240  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  34.65 
 
 		 437 aa  237  8e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  36.83 
 
 		 436 aa  237  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  33.8 
 
 		 431 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  33.18 
 
 		 436 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  32.8 
 
 		 430 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  30.9 
 
 		 436 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  33.41 
 
 		 451 aa  191  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  32.38 
 
 		 446 aa  190  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  31.21 
 
 		 433 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  32.59 
 
 		 418 aa  180  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  31.41 
 
 		 431 aa  179  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0415  aminoglycoside phosphotransferase  36.98 
 
 		 360 aa  177  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  30.62 
 
 		 452 aa  177  9e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  34.24 
 
 		 400 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  31.25 
 
 		 431 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  33.65 
 
 		 436 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  30.93 
 
 		 442 aa  175  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  30.65 
 
 		 431 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  33.17 
 
 		 395 aa  174  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  32.04 
 
 		 395 aa  172  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0159  aminotransferase  30.6 
 
 		 466 aa  171  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  29.05 
 
 		 419 aa  171  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.55 
 
 		 391 aa  171  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0230  aminotransferase  32.28 
 
 		 457 aa  170  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.7 
 
 		 393 aa  170  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.88 
 
 		 397 aa  169  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  30.67 
 
 		 421 aa  169  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  31.58 
 
 		 432 aa  169  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  29.62 
 
 		 428 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  32.92 
 
 		 400 aa  168  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  30.9 
 
 		 442 aa  168  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  30.79 
 
 		 465 aa  167  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.65 
 
 		 401 aa  167  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  33.02 
 
 		 436 aa  167  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  28.6 
 
 		 450 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  31.87 
 
 		 395 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  31.79 
 
 		 443 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  31.01 
 
 		 445 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  30.8 
 
 		 470 aa  166  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  30.67 
 
 		 453 aa  166  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  29.29 
 
 		 452 aa  164  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  28.13 
 
 		 450 aa  165  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  30.98 
 
 		 408 aa  164  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5226  aminoglycoside phosphotransferase  36.94 
 
 		 351 aa  164  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  32.2 
 
 		 394 aa  164  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  32.04 
 
 		 395 aa  163  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  29.93 
 
 		 433 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  29.93 
 
 		 433 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  30.13 
 
 		 444 aa  163  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>