More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4970 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  100 
 
 
431 aa  878    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  68.24 
 
 
436 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  68.24 
 
 
436 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  63.9 
 
 
433 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  63.23 
 
 
431 aa  545  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  61.05 
 
 
431 aa  531  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  59.53 
 
 
430 aa  510  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  59.05 
 
 
443 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0686  aminotransferase  60 
 
 
429 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  54.72 
 
 
431 aa  462  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  49.3 
 
 
436 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  37.12 
 
 
437 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  40.2 
 
 
448 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  36.66 
 
 
434 aa  246  8e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  33.91 
 
 
436 aa  243  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  35.75 
 
 
430 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  35.78 
 
 
446 aa  232  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  35.66 
 
 
444 aa  228  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  30.88 
 
 
454 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  30.65 
 
 
478 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  30.65 
 
 
454 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  30.65 
 
 
454 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  36.93 
 
 
437 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  30.65 
 
 
454 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  35.71 
 
 
441 aa  223  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  30.65 
 
 
468 aa  222  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  30.7 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  30.7 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  37.16 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  30.41 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  35.45 
 
 
440 aa  221  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  34.44 
 
 
431 aa  220  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  34.27 
 
 
452 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  33.56 
 
 
425 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  33.56 
 
 
425 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  30.86 
 
 
454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  30.18 
 
 
454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 
425 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  33.8 
 
 
461 aa  216  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  32.17 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  34.24 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  34.47 
 
 
1023 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  35.11 
 
 
439 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  33.18 
 
 
1016 aa  212  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  34.08 
 
 
465 aa  212  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  34.47 
 
 
394 aa  212  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  36.1 
 
 
465 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  35.33 
 
 
441 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  35.75 
 
 
390 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  33.56 
 
 
425 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  33.96 
 
 
450 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  30.65 
 
 
441 aa  210  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  33.18 
 
 
426 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  35.29 
 
 
396 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  31.34 
 
 
448 aa  209  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  33.64 
 
 
425 aa  209  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  33.18 
 
 
426 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  34.02 
 
 
1049 aa  209  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  35.66 
 
 
458 aa  206  5e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  31.18 
 
 
421 aa  206  8e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  36.45 
 
 
402 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  36.45 
 
 
402 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  31.31 
 
 
421 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  32.48 
 
 
432 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.93 
 
 
393 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  32.01 
 
 
442 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  33.03 
 
 
433 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  34.99 
 
 
432 aa  203  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5663  4-aminobutyrate aminotransferase  37.23 
 
 
429 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  32.85 
 
 
471 aa  202  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  36.3 
 
 
402 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  32.78 
 
 
465 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1867  4-aminobutyrate aminotransferase  31.54 
 
 
421 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  31.79 
 
 
426 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  31.47 
 
 
1018 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  31.79 
 
 
426 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  35.5 
 
 
418 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  31.79 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  32.41 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  33.18 
 
 
440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  30.56 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2619  diaminobutyrate-2-oxoglutarate transaminase  35.68 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0216574  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  30.56 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  33.64 
 
 
430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  31.63 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.34 
 
 
395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  33.64 
 
 
452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  34.39 
 
 
402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  31.89 
 
 
459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  36.03 
 
 
438 aa  200  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2636  4-aminobutyrate aminotransferase  32.71 
 
 
425 aa  199  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  33.18 
 
 
427 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.61 
 
 
399 aa  199  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1308  4-aminobutyrate aminotransferase  37.67 
 
 
450 aa  199  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518173  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  33.57 
 
 
390 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  32.24 
 
 
442 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1048  aminotransferase class-III  32.79 
 
 
462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  32.71 
 
 
427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.15 
 
 
401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  34.45 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.161601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>