More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0312 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  100 
 
 		 436 aa  858    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  83.64 
 
 		 436 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  97.94 
 
 		 436 aa  788    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  63.15 
 
 		 427 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  64.25 
 
 		 416 aa  504  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  61.84 
 
 		 433 aa  498  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  60.74 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  61.76 
 
 		 442 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  57.01 
 
 		 434 aa  475  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  58.29 
 
 		 434 aa  471  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  55.93 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  55.33 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  52.28 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  49.65 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  54.92 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  50 
 
 		 448 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  49.31 
 
 		 447 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  49.31 
 
 		 448 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  51.66 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  49.52 
 
 		 446 aa  405  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  50.94 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  47.64 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  47.02 
 
 		 429 aa  358  9e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  52.64 
 
 		 413 aa  355  5.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  48.69 
 
 		 978 aa  335  7e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  44.24 
 
 		 1023 aa  333  4e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  44.99 
 
 		 1015 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  44.32 
 
 		 1015 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  45.22 
 
 		 1015 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  43.93 
 
 		 1049 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  43.76 
 
 		 1016 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  44.06 
 
 		 1018 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  42.26 
 
 		 981 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  42.26 
 
 		 981 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  42.26 
 
 		 981 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  43.56 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  39.24 
 
 		 977 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  39.34 
 
 		 967 aa  275  9e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  41.18 
 
 		 994 aa  269  8.999999999999999e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  37.32 
 
 		 970 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  37.47 
 
 		 910 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  37.65 
 
 		 970 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  37.47 
 
 		 976 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  37.2 
 
 		 966 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  38.57 
 
 		 973 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  37.24 
 
 		 976 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  38.33 
 
 		 970 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  36.74 
 
 		 1003 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  38.17 
 
 		 973 aa  253  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  38.12 
 
 		 975 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  38.23 
 
 		 448 aa  247  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  37.15 
 
 		 974 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  34.52 
 
 		 431 aa  210  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  32.15 
 
 		 437 aa  209  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  34.44 
 
 		 431 aa  201  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  34.62 
 
 		 431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  34.17 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  34.73 
 
 		 443 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  33.25 
 
 		 433 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  35.8 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0686  aminotransferase  33.66 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 		 428 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  33.93 
 
 		 442 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  34.53 
 
 		 436 aa  179  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  36.67 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  34.84 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  34.57 
 
 		 430 aa  176  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  34.78 
 
 		 444 aa  176  8e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  35.66 
 
 		 422 aa  176  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  33.82 
 
 		 419 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.93 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  35.96 
 
 		 427 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.21 
 
 		 401 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.01 
 
 		 402 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  30.71 
 
 		 436 aa  173  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.41 
 
 		 399 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  34.64 
 
 		 391 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  33.25 
 
 		 421 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.94 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  31.07 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  32.57 
 
 		 442 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  32.87 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  32.74 
 
 		 430 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  33.25 
 
 		 425 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  34.94 
 
 		 457 aa  170  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  31.76 
 
 		 461 aa  169  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0947  aminotransferase class-III  34.99 
 
 		 395 aa  169  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0679656  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.6 
 
 		 391 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  35.11 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  31.38 
 
 		 445 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14390  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  38.44 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0775  aminotransferase class-III  33.08 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  31.97 
 
 		 465 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2355  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.96 
 
 		 460 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0339571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2583  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  31.65 
 
 		 458 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406627  hitchhiker  0.00247951 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  31.05 
 
 		 446 aa  166  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2713  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.43 
 
 		 458 aa  166  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000482772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  32.85 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0337  aminotransferase class-III  31.03 
 
 		 407 aa  166  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2679  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.3 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000398425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>