More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1896 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  100 
 
 		 432 aa  862    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  77.25 
 
 		 433 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  78.57 
 
 		 436 aa  687    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  66.9 
 
 		 446 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3251  aminotransferase class-III  67.63 
 
 		 428 aa  557  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  66.59 
 
 		 452 aa  557  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2878  aminotransferase class-III  67.77 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19268  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  61.31 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  61.77 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  62.8 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  61.94 
 
 		 451 aa  524  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  61.54 
 
 		 433 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  61.31 
 
 		 433 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  61.77 
 
 		 433 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  61.31 
 
 		 433 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  62.09 
 
 		 433 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  53.54 
 
 		 452 aa  499  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0839  aminotransferase  55.26 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.33368  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1466  aminotransferase  66.29 
 
 		 329 aa  348  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  39.03 
 
 		 465 aa  249  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  34.13 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  34.92 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  36.72 
 
 		 465 aa  235  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  34.06 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  34.31 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  35.28 
 
 		 448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  36.57 
 
 		 439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  35.28 
 
 		 448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  36.79 
 
 		 440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  33.82 
 
 		 454 aa  232  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  33.82 
 
 		 479 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  33.58 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  33.58 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  33.58 
 
 		 454 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  33.58 
 
 		 454 aa  230  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  33.58 
 
 		 454 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  33.58 
 
 		 454 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  34.46 
 
 		 448 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  36.06 
 
 		 428 aa  226  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  37.32 
 
 		 438 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  35.97 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  34.87 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  35.45 
 
 		 430 aa  224  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  37.32 
 
 		 453 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  35.6 
 
 		 444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  33.01 
 
 		 452 aa  223  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  32.37 
 
 		 441 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  35.34 
 
 		 437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  34.38 
 
 		 437 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  35.27 
 
 		 427 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.56 
 
 		 397 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  36.95 
 
 		 418 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  32.76 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  34.46 
 
 		 461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  36.88 
 
 		 445 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  34.05 
 
 		 464 aa  216  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  34.38 
 
 		 474 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  36.17 
 
 		 435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  34.04 
 
 		 464 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  34.71 
 
 		 438 aa  213  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1787  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  35.56 
 
 		 409 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  33.25 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3092  4-aminobutyrate aminotransferase  34 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.625534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  31.41 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  34.29 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0007  aminotransferase class-III  32.6 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.383992  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  35.15 
 
 		 447 aa  210  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  34.39 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  36.43 
 
 		 448 aa  210  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 448 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  32.92 
 
 		 445 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3420  aminotransferase class-III  32.85 
 
 		 458 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4677  4-aminobutyrate aminotransferase  34.65 
 
 		 422 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300302  normal  0.0763833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  34.64 
 
 		 427 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  33.09 
 
 		 426 aa  207  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  33.1 
 
 		 426 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  33.1 
 
 		 426 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4493  aminotransferase class-III  36.84 
 
 		 436 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  32.04 
 
 		 970 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  34.8 
 
 		 450 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  33.49 
 
 		 430 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  33.17 
 
 		 450 aa  206  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2583  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  35.28 
 
 		 458 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406627  hitchhiker  0.00247951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  35.03 
 
 		 975 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  33.1 
 
 		 426 aa  206  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  32.96 
 
 		 461 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  36.6 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  33.33 
 
 		 462 aa  206  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  32.85 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  34.49 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  32.55 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  36.54 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  34.45 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  32.85 
 
 		 426 aa  205  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  32.85 
 
 		 426 aa  205  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0848  4-aminobutyrate aminotransferase  34.12 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1331  aminotransferase  33.49 
 
 		 451 aa  205  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  34.28 
 
 		 475 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0564  Acetylornithine transaminase  35.98 
 
 		 461 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.129985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2918  aminotransferase class-III  38.42 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.337832  normal  0.0522713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>