More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4862 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  81.26 
 
 
456 aa  777    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  88.53 
 
 
461 aa  841    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  71.77 
 
 
458 aa  669    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  71.9 
 
 
460 aa  655    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  74.13 
 
 
458 aa  680    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  88.05 
 
 
461 aa  803    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  72.69 
 
 
457 aa  652    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  71.81 
 
 
456 aa  634    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  89.18 
 
 
461 aa  847    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  73.41 
 
 
458 aa  667    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  73.49 
 
 
464 aa  678    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  79.82 
 
 
438 aa  696    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  944    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  70.88 
 
 
468 aa  637    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  89.18 
 
 
461 aa  847    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  69 
 
 
459 aa  639    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  68.6 
 
 
448 aa  632  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  69.35 
 
 
464 aa  627  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  65.95 
 
 
462 aa  619  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  66.96 
 
 
454 aa  615  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  69.27 
 
 
448 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  65.47 
 
 
463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  57.02 
 
 
460 aa  540  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  53.25 
 
 
464 aa  487  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  50.11 
 
 
478 aa  427  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  50.95 
 
 
454 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  45.97 
 
 
465 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  45.83 
 
 
465 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  45.71 
 
 
465 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  45.97 
 
 
465 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  45.97 
 
 
465 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  45.79 
 
 
479 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  47.03 
 
 
462 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  45.61 
 
 
465 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  44.66 
 
 
449 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  44.06 
 
 
450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  42.25 
 
 
451 aa  318  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  41.23 
 
 
443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  42.89 
 
 
454 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  38.55 
 
 
456 aa  310  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  39.78 
 
 
451 aa  309  8e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  39.34 
 
 
455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  38.63 
 
 
454 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  40.05 
 
 
448 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  40.05 
 
 
448 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  39.81 
 
 
448 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  39.24 
 
 
455 aa  299  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  39.53 
 
 
449 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  39.24 
 
 
457 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  40.32 
 
 
470 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  37.65 
 
 
456 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  38.69 
 
 
468 aa  293  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  37.65 
 
 
456 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  37.73 
 
 
456 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  39.4 
 
 
470 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  37.15 
 
 
457 aa  291  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  38.34 
 
 
459 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  38.44 
 
 
451 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  37.68 
 
 
453 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  38.94 
 
 
470 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  37.05 
 
 
465 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  39.26 
 
 
458 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  40.41 
 
 
452 aa  289  9e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  37.77 
 
 
463 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  40.28 
 
 
478 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  37.53 
 
 
457 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  37.44 
 
 
454 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  41.37 
 
 
449 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  37.72 
 
 
463 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  37.68 
 
 
453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  38.32 
 
 
446 aa  287  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  37.53 
 
 
467 aa  286  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  38.79 
 
 
444 aa  286  5.999999999999999e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  38.85 
 
 
455 aa  285  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  37.44 
 
 
453 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  41.37 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  41.37 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  41.37 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  41.37 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  41.37 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  36.34 
 
 
459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  37.44 
 
 
453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  41.37 
 
 
449 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  36.68 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  37.38 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  36.45 
 
 
446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  36.45 
 
 
446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  36.45 
 
 
446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  39.27 
 
 
467 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  37.38 
 
 
466 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  41.37 
 
 
449 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  37.95 
 
 
463 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  37.81 
 
 
447 aa  282  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  39.16 
 
 
444 aa  282  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  35.7 
 
 
469 aa  282  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  37.15 
 
 
446 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  41.2 
 
 
442 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  35.79 
 
 
457 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  34.98 
 
 
465 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  36.75 
 
 
450 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>