More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6095 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  95.91 
 
 		 465 aa  921    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  94.62 
 
 		 465 aa  909    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  95.05 
 
 		 465 aa  912    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  88.53 
 
 		 462 aa  825    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  97.63 
 
 		 465 aa  934    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  952    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  94.62 
 
 		 465 aa  909    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  52.31 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  49.89 
 
 		 462 aa  435  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  49.34 
 
 		 459 aa  437  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  50.77 
 
 		 478 aa  427  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  48.12 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  46.97 
 
 		 448 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  45.66 
 
 		 458 aa  398  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  46.64 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  46.86 
 
 		 448 aa  398  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  46.74 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  46.29 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  47.02 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  48.15 
 
 		 456 aa  392  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  45.2 
 
 		 464 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  45.07 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  45.32 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  45.61 
 
 		 462 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  44.66 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  44.66 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  46.64 
 
 		 464 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  44.66 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  44.89 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  45.13 
 
 		 456 aa  364  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  43.83 
 
 		 468 aa  363  3e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  43.61 
 
 		 458 aa  361  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  45.43 
 
 		 438 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  41.78 
 
 		 479 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  40.35 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  39.6 
 
 		 466 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  42.06 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  39.91 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  38.58 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  42.05 
 
 		 456 aa  307  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  41.86 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  38.41 
 
 		 457 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  37.79 
 
 		 465 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  36.78 
 
 		 451 aa  303  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  38.19 
 
 		 455 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  38.43 
 
 		 455 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  38.19 
 
 		 454 aa  302  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  38.98 
 
 		 457 aa  300  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  38.62 
 
 		 453 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  37.09 
 
 		 456 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  37.09 
 
 		 456 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  38.39 
 
 		 453 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  38.39 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  38.44 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  37.31 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  38.67 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  37 
 
 		 468 aa  295  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  38.43 
 
 		 468 aa  294  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  38.17 
 
 		 453 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  40.5 
 
 		 449 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  40.5 
 
 		 449 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  37.95 
 
 		 463 aa  293  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  37.58 
 
 		 459 aa  292  7e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  37.45 
 
 		 458 aa  292  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  38.44 
 
 		 452 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  40.27 
 
 		 449 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  40.27 
 
 		 449 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  40.27 
 
 		 449 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  40.27 
 
 		 449 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  38.6 
 
 		 459 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  40.27 
 
 		 449 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  40.5 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  38.7 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  36.46 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  36.74 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  35.57 
 
 		 467 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  37.91 
 
 		 460 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  37.78 
 
 		 455 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  39.33 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  38.37 
 
 		 446 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  38.63 
 
 		 465 aa  290  4e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  36.95 
 
 		 469 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  38.55 
 
 		 446 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  38.55 
 
 		 446 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  38.55 
 
 		 446 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0847  hypothetical protein  39.68 
 
 		 473 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  38.19 
 
 		 450 aa  289  6e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1450  hypothetical protein  39.68 
 
 		 473 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235478  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2163  hypothetical protein  39.68 
 
 		 473 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000327141  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  37.72 
 
 		 485 aa  289  8e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  38.62 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  39 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  36.82 
 
 		 450 aa  289  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  38.1 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  36.73 
 
 		 471 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  38.77 
 
 		 450 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  38.53 
 
 		 449 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  38.78 
 
 		 446 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  35.81 
 
 		 456 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  37.91 
 
 		 456 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>