More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000637 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  100 
 
 
468 aa  973    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  68.18 
 
 
468 aa  658    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  62.09 
 
 
465 aa  614  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  61.35 
 
 
469 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  60.92 
 
 
465 aa  604  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  61.79 
 
 
464 aa  588  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  61.26 
 
 
464 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  61.26 
 
 
464 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  61.26 
 
 
464 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  61.26 
 
 
464 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  62.81 
 
 
459 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  61.18 
 
 
457 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  60.35 
 
 
459 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  60.61 
 
 
464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  60.61 
 
 
458 aa  580  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  60.13 
 
 
459 aa  581  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  60.31 
 
 
457 aa  578  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  60.09 
 
 
457 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  61.47 
 
 
463 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  60.22 
 
 
467 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  59.69 
 
 
457 aa  568  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  59 
 
 
463 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  58.39 
 
 
467 aa  561  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  58.89 
 
 
456 aa  555  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  56.83 
 
 
460 aa  535  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  46.12 
 
 
456 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  44.47 
 
 
455 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  45.18 
 
 
456 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  45.41 
 
 
456 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  41.91 
 
 
456 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  44.87 
 
 
461 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  41.87 
 
 
463 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  44.96 
 
 
455 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  44.62 
 
 
457 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  40.13 
 
 
461 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  42.07 
 
 
460 aa  378  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  41.27 
 
 
460 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  41.85 
 
 
459 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  40.79 
 
 
460 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  44.96 
 
 
454 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  42.55 
 
 
471 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  40.54 
 
 
463 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  43.26 
 
 
455 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  44.03 
 
 
453 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  40.54 
 
 
485 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  41.93 
 
 
460 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  41.27 
 
 
468 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  42.96 
 
 
456 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  42.26 
 
 
466 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  43.19 
 
 
450 aa  365  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  41.03 
 
 
460 aa  362  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  44.89 
 
 
457 aa  361  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  41.43 
 
 
460 aa  360  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  42.92 
 
 
456 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  42.92 
 
 
456 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  43.33 
 
 
453 aa  359  7e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  42.42 
 
 
454 aa  358  8e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  43.13 
 
 
451 aa  358  9.999999999999999e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  42.66 
 
 
456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  43.09 
 
 
453 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  40.4 
 
 
450 aa  356  5e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  43.09 
 
 
453 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  40.77 
 
 
463 aa  352  7e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  41.72 
 
 
456 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  40.93 
 
 
458 aa  350  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  41.5 
 
 
452 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  41.58 
 
 
452 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  42.82 
 
 
449 aa  345  7e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  41.58 
 
 
452 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  39.46 
 
 
459 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  42.28 
 
 
462 aa  345  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  40.35 
 
 
464 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  40.35 
 
 
464 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  40.35 
 
 
464 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  39.69 
 
 
461 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  39.69 
 
 
461 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  39.69 
 
 
465 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  40.85 
 
 
458 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  37.85 
 
 
467 aa  336  7e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  39.57 
 
 
477 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  40.53 
 
 
482 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  40.53 
 
 
480 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  39.78 
 
 
477 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  40.53 
 
 
480 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  40.75 
 
 
480 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  40.53 
 
 
480 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  39.83 
 
 
475 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  41.16 
 
 
459 aa  333  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  38.13 
 
 
459 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  39.25 
 
 
461 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  40.91 
 
 
455 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  41.65 
 
 
449 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  41.19 
 
 
463 aa  329  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  41.09 
 
 
478 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  39.43 
 
 
481 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  40.44 
 
 
455 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  42.76 
 
 
466 aa  326  6e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  37.31 
 
 
452 aa  325  8.000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  39.01 
 
 
478 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  38.89 
 
 
472 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>