More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0567 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  75.96 
 
 		 457 aa  697    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  947    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  66.74 
 
 		 458 aa  617  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  65.33 
 
 		 458 aa  615  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  63.66 
 
 		 464 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  64.13 
 
 		 461 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  64.13 
 
 		 461 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  65.47 
 
 		 462 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  63.91 
 
 		 461 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  62.95 
 
 		 448 aa  599  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  63.88 
 
 		 460 aa  600  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  63.62 
 
 		 456 aa  598  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  62.3 
 
 		 459 aa  595  1e-169  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  63.7 
 
 		 458 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  61.71 
 
 		 448 aa  578  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  63.96 
 
 		 456 aa  580  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  66.74 
 
 		 438 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  60.83 
 
 		 462 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  62.61 
 
 		 464 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  63.23 
 
 		 461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  60.34 
 
 		 468 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  59.24 
 
 		 454 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  52.81 
 
 		 460 aa  502  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  50.33 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  48.7 
 
 		 478 aa  418  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  45.52 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  45.07 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  44.62 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  44.94 
 
 		 454 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  44.01 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  44.01 
 
 		 465 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  44.01 
 
 		 465 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  45.66 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  44.55 
 
 		 479 aa  349  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  41.57 
 
 		 451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  42.12 
 
 		 449 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  39.91 
 
 		 451 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  38.46 
 
 		 455 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  42.24 
 
 		 448 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  42.24 
 
 		 448 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  42 
 
 		 448 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  43.45 
 
 		 450 aa  302  8.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  40.47 
 
 		 470 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  37.5 
 
 		 443 aa  300  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  40 
 
 		 458 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  40.28 
 
 		 470 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  37.56 
 
 		 454 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  40.28 
 
 		 470 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  37.64 
 
 		 467 aa  296  4e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  37.47 
 
 		 455 aa  296  6e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  38.94 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  36.65 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  36.38 
 
 		 466 aa  293  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  36.88 
 
 		 453 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  41.75 
 
 		 454 aa  292  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  36.88 
 
 		 453 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  37.99 
 
 		 457 aa  290  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  40.13 
 
 		 456 aa  289  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  37.95 
 
 		 456 aa  289  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  36.76 
 
 		 459 aa  289  9e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  36.43 
 
 		 453 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  36.14 
 
 		 456 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  36.63 
 
 		 454 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  36.14 
 
 		 456 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  37.75 
 
 		 464 aa  285  9e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  36.28 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  36.57 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  36.61 
 
 		 463 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  37.05 
 
 		 457 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  37.61 
 
 		 460 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  40.23 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  37.08 
 
 		 457 aa  280  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  37.81 
 
 		 456 aa  280  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4941  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  39.95 
 
 		 452 aa  279  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  35.83 
 
 		 452 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  36.97 
 
 		 471 aa  279  8e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  37.67 
 
 		 446 aa  279  9e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  38.84 
 
 		 463 aa  279  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  38.59 
 
 		 455 aa  279  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  40.68 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  36.95 
 
 		 467 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  38.69 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  37.9 
 
 		 446 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  36.57 
 
 		 459 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  36.67 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  38.36 
 
 		 446 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  37.9 
 
 		 446 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  37.21 
 
 		 446 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  37.21 
 
 		 446 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  37.21 
 
 		 446 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  37.35 
 
 		 459 aa  276  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  37.47 
 
 		 459 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2972  aminotransferase class-III  38.29 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.121159 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  35.49 
 
 		 467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2244  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  37.67 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  35.16 
 
 		 456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2042  taurin--pyruvate aminotransferase  37.81 
 
 		 460 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.291781 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  41.11 
 
 		 450 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  37.3 
 
 		 457 aa  273  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  36.82 
 
 		 449 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>