More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4078 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  71.78 
 
 		 456 aa  644    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  75.43 
 
 		 464 aa  694    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  960    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  68.46 
 
 		 458 aa  647    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  70.09 
 
 		 461 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  70.09 
 
 		 461 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  69.2 
 
 		 461 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  68.97 
 
 		 462 aa  623  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  69.25 
 
 		 461 aa  617  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  67.93 
 
 		 460 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  68.46 
 
 		 464 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  67.41 
 
 		 459 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  68.09 
 
 		 458 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  67.26 
 
 		 456 aa  601  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  66.59 
 
 		 458 aa  598  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  65.57 
 
 		 457 aa  600  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  64.33 
 
 		 448 aa  590  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  69.48 
 
 		 438 aa  591  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  65.53 
 
 		 448 aa  568  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  60.34 
 
 		 463 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  62.36 
 
 		 462 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  62.3 
 
 		 454 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  55.73 
 
 		 460 aa  512  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  50.22 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  48.16 
 
 		 478 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  48.65 
 
 		 454 aa  385  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  45.16 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  44.05 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  44.42 
 
 		 465 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  44.42 
 
 		 465 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  44.42 
 
 		 465 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  43.83 
 
 		 465 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  43.65 
 
 		 479 aa  363  4e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  45.43 
 
 		 462 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  44.26 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  44.08 
 
 		 451 aa  317  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  43.78 
 
 		 454 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  42.44 
 
 		 449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  40.27 
 
 		 464 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  39.19 
 
 		 458 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  37.64 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  37.47 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  38.77 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  41.75 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  36.76 
 
 		 443 aa  292  9e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  37.56 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  36.61 
 
 		 453 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  37.78 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  38.57 
 
 		 466 aa  289  6e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  36.43 
 
 		 454 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  36.83 
 
 		 453 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  36.82 
 
 		 453 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  36.82 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  41.42 
 
 		 449 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  41.42 
 
 		 449 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  41.42 
 
 		 449 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  41.69 
 
 		 449 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  41.42 
 
 		 449 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  41.42 
 
 		 449 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  41.42 
 
 		 449 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  37.28 
 
 		 471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  37.9 
 
 		 457 aa  287  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  41.42 
 
 		 449 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  36.04 
 
 		 456 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  36.04 
 
 		 456 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  42.51 
 
 		 448 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  42.51 
 
 		 448 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  42.23 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  37.11 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  36.43 
 
 		 454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  40.62 
 
 		 452 aa  282  9e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  38.57 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  38.62 
 
 		 450 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  36.67 
 
 		 452 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  38 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  37.56 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1582  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.71 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.603934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  39.69 
 
 		 450 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  37.83 
 
 		 457 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  37.9 
 
 		 470 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  38.12 
 
 		 470 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  36.3 
 
 		 466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  39.68 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  35.6 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  36.82 
 
 		 455 aa  273  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  37.93 
 
 		 444 aa  272  9e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  37.97 
 
 		 466 aa  272  9e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  36.72 
 
 		 456 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  37.92 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  36.63 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  38.34 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  37.92 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  37.31 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  35.37 
 
 		 446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  35.37 
 
 		 446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  35.37 
 
 		 446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  36.54 
 
 		 460 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  37.03 
 
 		 454 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  37.53 
 
 		 466 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  37.53 
 
 		 466 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>