More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3225 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  69.82 
 
 		 457 aa  636    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  69.57 
 
 		 462 aa  657    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  74.38 
 
 		 448 aa  689    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  942    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  72.01 
 
 		 456 aa  658    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  75.5 
 
 		 460 aa  686    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  79.16 
 
 		 458 aa  717    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  71.81 
 
 		 462 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  69.62 
 
 		 461 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  69.62 
 
 		 461 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  69.98 
 
 		 458 aa  656    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  75.17 
 
 		 448 aa  669    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  74.02 
 
 		 464 aa  680    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  72.51 
 
 		 459 aa  688    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  70.56 
 
 		 458 aa  628  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  68.58 
 
 		 461 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  68.44 
 
 		 461 aa  618  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  67.26 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  66.29 
 
 		 454 aa  609  1e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  70.64 
 
 		 438 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  66.29 
 
 		 464 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  63.53 
 
 		 463 aa  588  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  60.44 
 
 		 460 aa  564  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  56.98 
 
 		 464 aa  517  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  50.89 
 
 		 478 aa  437  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  50.23 
 
 		 454 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  49.54 
 
 		 465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  47.76 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  47.89 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  48.61 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  48.61 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  48.13 
 
 		 462 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  48.61 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  45.58 
 
 		 479 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  39.07 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  39.07 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  39.16 
 
 		 456 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  39.16 
 
 		 456 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  42.01 
 
 		 451 aa  320  3.9999999999999996e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  44.36 
 
 		 450 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  40.72 
 
 		 464 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  37.61 
 
 		 455 aa  312  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  42.54 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  38.05 
 
 		 457 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  37.89 
 
 		 454 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  37.75 
 
 		 453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  43.33 
 
 		 454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  40.84 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  38.41 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  37.31 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  37.95 
 
 		 466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  40.19 
 
 		 443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  40.05 
 
 		 456 aa  304  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  38.5 
 
 		 457 aa  303  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  40.23 
 
 		 478 aa  303  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  38.72 
 
 		 460 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  39.22 
 
 		 470 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  37.09 
 
 		 453 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  37.09 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  38.57 
 
 		 452 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  40.22 
 
 		 463 aa  299  8e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  40.57 
 
 		 470 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  39.07 
 
 		 470 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  40.09 
 
 		 458 aa  296  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  37.89 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  38.34 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  43.42 
 
 		 448 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  38.81 
 
 		 460 aa  292  8e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  39.72 
 
 		 459 aa  292  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  37.84 
 
 		 456 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  40.8 
 
 		 452 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  36.77 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  40.09 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  37.44 
 
 		 452 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  39.76 
 
 		 451 aa  290  3e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  37.75 
 
 		 471 aa  290  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  43.16 
 
 		 448 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  43.16 
 
 		 448 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  37.06 
 
 		 461 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  38.72 
 
 		 449 aa  286  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  40.58 
 
 		 442 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  40.19 
 
 		 465 aa  286  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  38.67 
 
 		 450 aa  286  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  41.27 
 
 		 468 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  40.58 
 
 		 442 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  39.72 
 
 		 466 aa  285  9e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  39.53 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  36.61 
 
 		 457 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  39.77 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  37.03 
 
 		 455 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1582  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.6 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.603934  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  37.19 
 
 		 467 aa  281  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  39.24 
 
 		 463 aa  280  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2100  aminotransferase class-III  39.58 
 
 		 461 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  37.03 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1580  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.64 
 
 		 455 aa  279  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  37.22 
 
 		 478 aa  280  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4941  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  37.17 
 
 		 452 aa  279  9e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  39.01 
 
 		 442 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  37.5 
 
 		 442 aa  278  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>