More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_63500 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  71.84 
 
 		 470 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  72.28 
 
 		 470 aa  688    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  72.06 
 
 		 470 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  964    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  52.63 
 
 		 465 aa  466  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  54.04 
 
 		 463 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  48.26 
 
 		 467 aa  455  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2091  hypothetical protein  47.43 
 
 		 473 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1450  hypothetical protein  46.55 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235478  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0847  hypothetical protein  46.55 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2163  hypothetical protein  46.55 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000327141  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0436  hypothetical protein  46.12 
 
 		 473 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1858  hypothetical protein  46.1 
 
 		 473 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000249145  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0532  hypothetical protein  46.1 
 
 		 473 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601876  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2835  hypothetical protein  46.25 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.561415  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3534  hypothetical protein  46.25 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.631271  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3177  hypothetical protein  46.25 
 
 		 467 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.060239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  41.26 
 
 		 463 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  39.82 
 
 		 466 aa  352  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  39.82 
 
 		 469 aa  342  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  40.35 
 
 		 465 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  39.19 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  38.43 
 
 		 457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  40.96 
 
 		 464 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  40.96 
 
 		 464 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  39.64 
 
 		 460 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  39.73 
 
 		 457 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  41.09 
 
 		 464 aa  332  6e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  39.36 
 
 		 456 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  39.36 
 
 		 456 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  41.11 
 
 		 456 aa  331  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  37.75 
 
 		 455 aa  329  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  39.05 
 
 		 452 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  39.74 
 
 		 459 aa  329  8e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  39.29 
 
 		 452 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  41.63 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  38.7 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  38.58 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  40.31 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  38.57 
 
 		 456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  40.78 
 
 		 464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  37.87 
 
 		 470 aa  327  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  38.49 
 
 		 465 aa  327  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  40.45 
 
 		 451 aa  325  7e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  41.54 
 
 		 458 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  38.81 
 
 		 452 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  38.32 
 
 		 454 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  38.39 
 
 		 471 aa  323  3e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  40.27 
 
 		 456 aa  323  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  39.87 
 
 		 464 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  39.61 
 
 		 459 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  42.49 
 
 		 449 aa  322  9.000000000000001e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  38.56 
 
 		 467 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  39.87 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  37.87 
 
 		 455 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  40.22 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  39.39 
 
 		 468 aa  320  5e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  40.7 
 
 		 466 aa  319  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  39.22 
 
 		 466 aa  319  6e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  37.44 
 
 		 454 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  36.96 
 
 		 453 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  36.96 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0052  hypothetical protein  38.18 
 
 		 461 aa  317  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  39.29 
 
 		 459 aa  316  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  36.9 
 
 		 453 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  37.97 
 
 		 478 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  36.51 
 
 		 453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  39.48 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  38.24 
 
 		 458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  39.39 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  38.73 
 
 		 463 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  38.41 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  38.12 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  40.35 
 
 		 454 aa  310  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  39.91 
 
 		 450 aa  310  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  38.03 
 
 		 457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  36.8 
 
 		 443 aa  309  8e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  38.17 
 
 		 458 aa  309  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  37.53 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  36.91 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  40.49 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  37.75 
 
 		 466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  38.35 
 
 		 464 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  36.87 
 
 		 450 aa  306  4.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  38.44 
 
 		 458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  37.53 
 
 		 466 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  37.53 
 
 		 466 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  38.03 
 
 		 464 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  38.03 
 
 		 464 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  38.22 
 
 		 461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  38.26 
 
 		 459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  37.09 
 
 		 467 aa  304  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  36.61 
 
 		 458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  36.74 
 
 		 460 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  38.3 
 
 		 456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  37.86 
 
 		 478 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  38.66 
 
 		 457 aa  303  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  38.22 
 
 		 455 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  38.03 
 
 		 457 aa  302  7.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  36.87 
 
 		 466 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>