More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4959 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  80.35 
 
 		 463 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  75.22 
 
 		 467 aa  714    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  961    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  79.43 
 
 		 463 aa  748    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  60.22 
 
 		 468 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  58.08 
 
 		 465 aa  554  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  58.17 
 
 		 465 aa  554  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  57.39 
 
 		 469 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  58.19 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  58.73 
 
 		 464 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  57.3 
 
 		 468 aa  538  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  58.41 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  58.41 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  58.19 
 
 		 464 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  57.76 
 
 		 464 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  56.92 
 
 		 459 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  53.54 
 
 		 457 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  53.88 
 
 		 456 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  54.36 
 
 		 457 aa  505  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  53.28 
 
 		 457 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  52.95 
 
 		 457 aa  499  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  51.85 
 
 		 458 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  51.98 
 
 		 460 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  49.78 
 
 		 459 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  50.44 
 
 		 459 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  45.77 
 
 		 461 aa  418  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  43.56 
 
 		 456 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  43.48 
 
 		 456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  43.7 
 
 		 456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  42.64 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  44.25 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  45.35 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  45.05 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  42.79 
 
 		 459 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  44.49 
 
 		 460 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  43.93 
 
 		 463 aa  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  44.44 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  43.96 
 
 		 485 aa  382  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  41.97 
 
 		 461 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  44.04 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  41.96 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  41.72 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  42.38 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  42.42 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  43.5 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  43.93 
 
 		 463 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  41.79 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  41.28 
 
 		 468 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  43.56 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  42.25 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  40.56 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  44.71 
 
 		 462 aa  364  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  43.07 
 
 		 454 aa  363  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  43.21 
 
 		 450 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  40.98 
 
 		 459 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  41.7 
 
 		 460 aa  361  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  42 
 
 		 451 aa  360  4e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  40.75 
 
 		 458 aa  355  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  40.92 
 
 		 455 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  41.14 
 
 		 449 aa  352  7e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  41.35 
 
 		 457 aa  352  8.999999999999999e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  41.52 
 
 		 454 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  41.13 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  41.27 
 
 		 456 aa  349  5e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  40.83 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  41.78 
 
 		 455 aa  345  8e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  40.6 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4250  aminotransferase  39.25 
 
 		 457 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.533724  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  40.69 
 
 		 453 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  40.48 
 
 		 453 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  42 
 
 		 475 aa  342  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  40.26 
 
 		 453 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  42.98 
 
 		 451 aa  341  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 480 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 480 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 480 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  40.7 
 
 		 464 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  40.67 
 
 		 461 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  40.93 
 
 		 465 aa  338  9e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  41.56 
 
 		 477 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  40.44 
 
 		 461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  41.56 
 
 		 477 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  42.57 
 
 		 478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  40.7 
 
 		 464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  40.7 
 
 		 464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  41.99 
 
 		 452 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  41.11 
 
 		 481 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3984  aminotransferase class-III  40 
 
 		 453 aa  333  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319262  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  39.82 
 
 		 465 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  39.04 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  41.76 
 
 		 452 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2033  aminotransferase class-III  40.98 
 
 		 455 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0379  aminotransferase  40.98 
 
 		 455 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.996959  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  38.89 
 
 		 466 aa  332  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  38.18 
 
 		 470 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  37.91 
 
 		 470 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  39.78 
 
 		 461 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  41.05 
 
 		 463 aa  329  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>