More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1407 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  75.23 
 
 		 455 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  74.55 
 
 		 455 aa  693    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  100 
 
 		 456 aa  941    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  60.54 
 
 		 460 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  59.15 
 
 		 466 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  58.84 
 
 		 451 aa  561  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  59.54 
 
 		 455 aa  551  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  58.85 
 
 		 454 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  59.55 
 
 		 457 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  58.17 
 
 		 455 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  57.8 
 
 		 453 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  58.93 
 
 		 456 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  58.93 
 
 		 456 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  59.72 
 
 		 457 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  58.16 
 
 		 454 aa  537  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  57.8 
 
 		 453 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  57.57 
 
 		 453 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  56.65 
 
 		 478 aa  529  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  57.01 
 
 		 453 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  57.44 
 
 		 482 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  56.95 
 
 		 464 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  56.95 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  56.95 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  57.89 
 
 		 480 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  57.21 
 
 		 481 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  56.05 
 
 		 461 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  56.73 
 
 		 475 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  57.44 
 
 		 477 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  57.67 
 
 		 480 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  55.83 
 
 		 461 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  56.06 
 
 		 477 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  56.06 
 
 		 476 aa  519  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  57.44 
 
 		 480 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  56.05 
 
 		 461 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  57.67 
 
 		 477 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  57.44 
 
 		 480 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  56.19 
 
 		 459 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  57.11 
 
 		 466 aa  514  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  55.38 
 
 		 472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  54.9 
 
 		 465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  55.38 
 
 		 472 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  55.38 
 
 		 472 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  55.15 
 
 		 475 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  55.15 
 
 		 472 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  57.11 
 
 		 478 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  57.69 
 
 		 464 aa  514  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  53.72 
 
 		 471 aa  514  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  55.15 
 
 		 475 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  54.02 
 
 		 470 aa  509  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  53.41 
 
 		 452 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  53.19 
 
 		 452 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  53.41 
 
 		 452 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  54.4 
 
 		 478 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  54.25 
 
 		 463 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  54.69 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  52.29 
 
 		 460 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  50.67 
 
 		 460 aa  480  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  52.38 
 
 		 458 aa  477  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  52.06 
 
 		 460 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  52.82 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2871  putative aminotransferase  51.95 
 
 		 460 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4932  putative aminotransferase  51.5 
 
 		 456 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  52.25 
 
 		 465 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2588  putative aminotransferase  51.29 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155274  normal  0.308476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3250  putative aminotransferase  51.29 
 
 		 460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3128  putative aminotransferase  51.29 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  44.3 
 
 		 456 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  42.58 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  45.05 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  43.02 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  42.57 
 
 		 456 aa  363  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  41.07 
 
 		 459 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  42.34 
 
 		 456 aa  362  9e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  42.09 
 
 		 468 aa  359  5e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  42.41 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  42.42 
 
 		 460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  42.89 
 
 		 485 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  42.67 
 
 		 463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  42.44 
 
 		 449 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  42.66 
 
 		 454 aa  355  7.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  42.63 
 
 		 460 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  41.2 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  41.78 
 
 		 465 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  43.14 
 
 		 459 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  43.14 
 
 		 464 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  43.14 
 
 		 464 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  40.89 
 
 		 469 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  41.72 
 
 		 468 aa  350  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  42.2 
 
 		 468 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  43.14 
 
 		 464 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  42.19 
 
 		 457 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  42.3 
 
 		 450 aa  350  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  43.57 
 
 		 455 aa  350  4e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  41.27 
 
 		 467 aa  349  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  42.48 
 
 		 464 aa  349  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  42.7 
 
 		 464 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  43.27 
 
 		 462 aa  349  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  42.7 
 
 		 464 aa  348  9e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  39.28 
 
 		 467 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  40.84 
 
 		 460 aa  345  8e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>