More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2727 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  100 
 
 
478 aa  976    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  60.9 
 
 
453 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  60.22 
 
 
455 aa  565  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  59.56 
 
 
454 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  56.7 
 
 
456 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  58.11 
 
 
455 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  58.67 
 
 
454 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  60.45 
 
 
453 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  56.7 
 
 
456 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  60.22 
 
 
453 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  60 
 
 
453 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  59.08 
 
 
457 aa  557  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  58.26 
 
 
466 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  57.84 
 
 
455 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  57.21 
 
 
459 aa  554  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  59.15 
 
 
452 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  57.27 
 
 
471 aa  548  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  58.42 
 
 
457 aa  548  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  57.08 
 
 
470 aa  542  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  57.59 
 
 
452 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  57.59 
 
 
452 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  57.34 
 
 
455 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  55.72 
 
 
465 aa  531  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  54.95 
 
 
460 aa  530  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  53.27 
 
 
451 aa  525  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  56.92 
 
 
464 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  57.11 
 
 
456 aa  514  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  53.61 
 
 
478 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  50.77 
 
 
460 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  54.88 
 
 
478 aa  498  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  53.44 
 
 
481 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  52.77 
 
 
482 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  52.52 
 
 
472 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  52.18 
 
 
475 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  52.3 
 
 
472 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  52.74 
 
 
472 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  52.18 
 
 
475 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  54.88 
 
 
465 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  52.52 
 
 
472 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  53.79 
 
 
464 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  53.74 
 
 
475 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  53.3 
 
 
477 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  55.26 
 
 
465 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  53.3 
 
 
477 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  52.33 
 
 
477 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  52.33 
 
 
476 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  53.32 
 
 
480 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  53.2 
 
 
466 aa  483  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  53.57 
 
 
464 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  52.78 
 
 
461 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  53.57 
 
 
464 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  53.32 
 
 
480 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  53.32 
 
 
480 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  52.88 
 
 
480 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  54.2 
 
 
458 aa  481  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  52.78 
 
 
461 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  53.04 
 
 
465 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  52.56 
 
 
461 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  49.45 
 
 
460 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2871  putative aminotransferase  49.89 
 
 
460 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  50.22 
 
 
463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  49.34 
 
 
460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2588  putative aminotransferase  50.81 
 
 
460 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155274  normal  0.308476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3128  putative aminotransferase  50.81 
 
 
460 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3250  putative aminotransferase  50.35 
 
 
460 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4932  putative aminotransferase  49.89 
 
 
456 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  42.53 
 
 
456 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  40.32 
 
 
456 aa  342  9e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  39.61 
 
 
463 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  41.52 
 
 
463 aa  338  9e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  41.56 
 
 
456 aa  336  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  40.04 
 
 
459 aa  335  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  38.79 
 
 
456 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  39.43 
 
 
463 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  39.43 
 
 
460 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  39.14 
 
 
465 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  41.5 
 
 
468 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  40.57 
 
 
460 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  39.43 
 
 
485 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  41.24 
 
 
458 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  41.04 
 
 
449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  38.67 
 
 
451 aa  327  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  38.01 
 
 
461 aa  327  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  40.71 
 
 
460 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  38.36 
 
 
456 aa  323  5e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  39.82 
 
 
451 aa  323  5e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  40.77 
 
 
459 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  39.51 
 
 
461 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  39.91 
 
 
456 aa  322  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  39.83 
 
 
460 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  38.15 
 
 
456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  38.6 
 
 
470 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  39.4 
 
 
446 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  39.4 
 
 
446 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  38.94 
 
 
443 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  41.53 
 
 
450 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  39.4 
 
 
446 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  39.4 
 
 
446 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  38.16 
 
 
470 aa  319  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  39.05 
 
 
469 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>