More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3014 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  79.25 
 
 
472 aa  803    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  78.96 
 
 
475 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  78.96 
 
 
475 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  100 
 
 
480 aa  995    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  79.05 
 
 
472 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  96.04 
 
 
475 aa  946    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  88.13 
 
 
461 aa  823    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  97.29 
 
 
480 aa  920    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  83.58 
 
 
478 aa  832    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  81.12 
 
 
477 aa  808    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  80.83 
 
 
476 aa  804    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  96.67 
 
 
477 aa  954    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  79.46 
 
 
472 aa  805    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  84.62 
 
 
481 aa  823    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  89.98 
 
 
461 aa  835    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  91.13 
 
 
464 aa  843    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  90.47 
 
 
465 aa  833    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  99.79 
 
 
480 aa  995    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  90.69 
 
 
464 aa  840    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  79.25 
 
 
472 aa  804    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  89.76 
 
 
461 aa  832    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  96.67 
 
 
477 aa  954    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  86.75 
 
 
482 aa  827    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  90.69 
 
 
464 aa  840    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  99.79 
 
 
480 aa  995    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  60.27 
 
 
455 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  60.44 
 
 
457 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  59.91 
 
 
460 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  60.49 
 
 
464 aa  567  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  59.25 
 
 
460 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  56.98 
 
 
454 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  57.59 
 
 
454 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  57.17 
 
 
460 aa  557  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  57.14 
 
 
455 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  58.65 
 
 
456 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  58.59 
 
 
457 aa  554  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  58.65 
 
 
456 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  58.56 
 
 
453 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2871  putative aminotransferase  58.59 
 
 
460 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4932  putative aminotransferase  60 
 
 
456 aa  548  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  57.21 
 
 
453 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  58.33 
 
 
453 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  58.11 
 
 
453 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  56.39 
 
 
466 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  57.43 
 
 
452 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  57.21 
 
 
452 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  56.5 
 
 
451 aa  535  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  57.21 
 
 
452 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  58.41 
 
 
463 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  55.31 
 
 
470 aa  528  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  57.67 
 
 
456 aa  529  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3250  putative aminotransferase  58.48 
 
 
460 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2588  putative aminotransferase  58.48 
 
 
460 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155274  normal  0.308476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3128  putative aminotransferase  58.48 
 
 
460 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  55.56 
 
 
459 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  53.96 
 
 
471 aa  504  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  54.95 
 
 
455 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  54.13 
 
 
478 aa  499  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  51.76 
 
 
460 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  53.83 
 
 
455 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  52.95 
 
 
478 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  54.89 
 
 
465 aa  490  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  51.13 
 
 
466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  52.32 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  50.78 
 
 
458 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  51.77 
 
 
465 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  42.13 
 
 
463 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  41.43 
 
 
456 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  40.86 
 
 
456 aa  363  4e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  40.36 
 
 
456 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  43.75 
 
 
468 aa  361  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  42.26 
 
 
469 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  39.64 
 
 
456 aa  352  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  40.17 
 
 
456 aa  350  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  41.44 
 
 
460 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  39.91 
 
 
485 aa  347  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  41.78 
 
 
467 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  39.96 
 
 
456 aa  348  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  40.9 
 
 
463 aa  347  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  41.44 
 
 
460 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  41.24 
 
 
455 aa  346  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  41.39 
 
 
463 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  41.02 
 
 
458 aa  344  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  39.69 
 
 
459 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  41.22 
 
 
468 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  40.53 
 
 
468 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  43.71 
 
 
459 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  40.89 
 
 
465 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  39.05 
 
 
461 aa  335  9e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  37.36 
 
 
467 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  41.91 
 
 
464 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  41.91 
 
 
464 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  41.91 
 
 
464 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  39.39 
 
 
467 aa  329  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  39.61 
 
 
463 aa  329  6e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  38.55 
 
 
459 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  38.55 
 
 
460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  40.67 
 
 
463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  41.69 
 
 
464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  38.44 
 
 
457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>