More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5230 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  84.33 
 
 		 456 aa  795    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  100 
 
 		 456 aa  932    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  60.7 
 
 		 456 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  58.1 
 
 		 456 aa  531  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  57.31 
 
 		 461 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  56.63 
 
 		 456 aa  522  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  56.85 
 
 		 456 aa  523  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  57.44 
 
 		 455 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  56.14 
 
 		 461 aa  511  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  54.32 
 
 		 485 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  54.26 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  53.64 
 
 		 463 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  51.15 
 
 		 459 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  52.73 
 
 		 460 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  52.05 
 
 		 460 aa  481  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  50.92 
 
 		 463 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  54.77 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  52.39 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  54.09 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  52.02 
 
 		 459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  50.57 
 
 		 468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  50.34 
 
 		 460 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  49.89 
 
 		 460 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  52.05 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  48.97 
 
 		 450 aa  428  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  46.45 
 
 		 463 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  47.22 
 
 		 460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  44.94 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  44.04 
 
 		 467 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  43.62 
 
 		 460 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  45.39 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  44.7 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9130  aminotransferase  44.84 
 
 		 463 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  45.15 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  44.7 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  43.47 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3984  aminotransferase class-III  43.02 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319262  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  43.75 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  44.69 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4250  aminotransferase  44.68 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.533724  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  45.06 
 
 		 464 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  45.52 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  44.62 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0379  aminotransferase  43.64 
 
 		 455 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.996959  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  41.91 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2033  aminotransferase class-III  43.41 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  44.83 
 
 		 464 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  43.64 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0857  aminotransferase class-III  43.71 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  44.52 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  42.36 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  43.28 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  44.99 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  43.18 
 
 		 466 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  42.79 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  42.89 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  42.18 
 
 		 453 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  43.15 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  41.97 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  42.48 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  42.66 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  42.41 
 
 		 456 aa  372  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  41.54 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  43.51 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  44.49 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  42.66 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  41.59 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  41.27 
 
 		 453 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  41.18 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  41.27 
 
 		 453 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  41.83 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  42.56 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  42.82 
 
 		 455 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  40.82 
 
 		 453 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  41.14 
 
 		 452 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  44.32 
 
 		 458 aa  361  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  42.29 
 
 		 456 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  42.29 
 
 		 456 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  41.08 
 
 		 457 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  41.06 
 
 		 459 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  44.04 
 
 		 464 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  40.58 
 
 		 472 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  40.58 
 
 		 475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  40.58 
 
 		 475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  40.58 
 
 		 472 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  40.58 
 
 		 472 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  40.58 
 
 		 472 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1121  aminotransferase  40.72 
 
 		 453 aa  351  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.713073  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  40.23 
 
 		 457 aa  351  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  39.69 
 
 		 480 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  39.86 
 
 		 460 aa  350  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  39.46 
 
 		 480 aa  349  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  39.46 
 
 		 480 aa  349  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  39.69 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  40.13 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  39.64 
 
 		 475 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  39.42 
 
 		 477 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  39.69 
 
 		 476 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  40.09 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  40.09 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>