More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0727 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  80.49 
 
 
464 aa  765    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  80.62 
 
 
478 aa  800    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  99.15 
 
 
472 aa  970    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  79.05 
 
 
480 aa  791    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  80.58 
 
 
477 aa  805    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  96.22 
 
 
475 aa  939    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  81.55 
 
 
475 aa  810    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  99.15 
 
 
472 aa  970    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  80.88 
 
 
461 aa  766    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  100 
 
 
472 aa  979    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  78.95 
 
 
461 aa  754    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  79.67 
 
 
480 aa  788    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  80.27 
 
 
464 aa  764    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  95.39 
 
 
477 aa  912    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  93.7 
 
 
476 aa  896    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  81.68 
 
 
482 aa  788    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  96.22 
 
 
475 aa  939    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  81.24 
 
 
481 aa  782    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  79.05 
 
 
480 aa  791    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  80.27 
 
 
464 aa  764    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  79.25 
 
 
480 aa  791    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  99.15 
 
 
472 aa  971    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  80.44 
 
 
461 aa  762    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  80.58 
 
 
477 aa  806    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  80.44 
 
 
465 aa  768    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  59.87 
 
 
455 aa  591  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  59.11 
 
 
457 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  59.82 
 
 
464 aa  567  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  58.01 
 
 
456 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  58.01 
 
 
456 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  57.81 
 
 
455 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  57.37 
 
 
454 aa  561  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  56.05 
 
 
453 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  56.73 
 
 
454 aa  554  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  56.73 
 
 
453 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  56.73 
 
 
453 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  55.95 
 
 
460 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  56.5 
 
 
453 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  57.75 
 
 
457 aa  551  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  55.33 
 
 
460 aa  547  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  56.69 
 
 
452 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  56.46 
 
 
452 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  55.95 
 
 
460 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  55.28 
 
 
466 aa  537  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  54.26 
 
 
451 aa  532  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4932  putative aminotransferase  58.94 
 
 
456 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  56.24 
 
 
452 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2871  putative aminotransferase  56.61 
 
 
460 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  56.64 
 
 
463 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  54.66 
 
 
470 aa  531  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  55.38 
 
 
456 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  54.02 
 
 
459 aa  518  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  54.73 
 
 
455 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3250  putative aminotransferase  57.21 
 
 
460 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  55.63 
 
 
455 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2588  putative aminotransferase  56.99 
 
 
460 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155274  normal  0.308476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3128  putative aminotransferase  56.99 
 
 
460 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  51.32 
 
 
471 aa  501  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  52.52 
 
 
478 aa  498  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  50.22 
 
 
460 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  53.47 
 
 
458 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  52.76 
 
 
465 aa  490  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  51.06 
 
 
478 aa  481  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  51.21 
 
 
465 aa  458  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  50 
 
 
466 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  50.56 
 
 
465 aa  455  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  42.15 
 
 
456 aa  371  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  40.59 
 
 
456 aa  362  9e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  39.96 
 
 
463 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  41.56 
 
 
460 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  41.65 
 
 
460 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  41.96 
 
 
468 aa  356  5.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  40.58 
 
 
456 aa  352  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  39.95 
 
 
456 aa  352  8e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  41.11 
 
 
468 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  39.14 
 
 
485 aa  346  6e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  39.51 
 
 
456 aa  346  7e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  39.91 
 
 
455 aa  345  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  39.78 
 
 
463 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  39.29 
 
 
456 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  38.04 
 
 
467 aa  340  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  39.5 
 
 
461 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  38.72 
 
 
459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  39.74 
 
 
467 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  38.33 
 
 
460 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  38.89 
 
 
469 aa  336  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  39.64 
 
 
458 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  39.11 
 
 
468 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  37.89 
 
 
460 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  38.2 
 
 
463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  39.5 
 
 
463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  39.33 
 
 
463 aa  326  7e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  40.64 
 
 
459 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  39.59 
 
 
459 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  38.24 
 
 
467 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  37.33 
 
 
465 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  39.14 
 
 
462 aa  323  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  40.62 
 
 
449 aa  320  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  37.78 
 
 
457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  40.14 
 
 
451 aa  319  7.999999999999999e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>