More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1296 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  100 
 
 		 460 aa  958    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  56.73 
 
 		 454 aa  561  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  55.58 
 
 		 455 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  55.9 
 
 		 454 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  55.13 
 
 		 457 aa  548  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  55.8 
 
 		 453 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  55.8 
 
 		 453 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  55.8 
 
 		 453 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  55.53 
 
 		 460 aa  544  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  54.29 
 
 		 456 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  54.22 
 
 		 457 aa  542  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  54.29 
 
 		 456 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  55.58 
 
 		 453 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  53.9 
 
 		 455 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  54.19 
 
 		 466 aa  537  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  54.48 
 
 		 452 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  53.81 
 
 		 452 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  52.94 
 
 		 451 aa  522  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  54.04 
 
 		 452 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  52.01 
 
 		 471 aa  518  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  52.41 
 
 		 470 aa  518  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  53.95 
 
 		 464 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  53.91 
 
 		 478 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  52.42 
 
 		 458 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  53.54 
 
 		 465 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  52.83 
 
 		 455 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  50.77 
 
 		 478 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  50.33 
 
 		 459 aa  500  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  52.55 
 
 		 482 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  51.7 
 
 		 455 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  52.89 
 
 		 464 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  52.55 
 
 		 461 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  52.55 
 
 		 481 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  51.32 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  51.99 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  52.89 
 
 		 464 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  52.33 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  52.89 
 
 		 464 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  52.11 
 
 		 480 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  51.98 
 
 		 475 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  51.19 
 
 		 477 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  51.19 
 
 		 477 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  50.33 
 
 		 472 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  50.22 
 
 		 472 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  51 
 
 		 477 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  51.11 
 
 		 476 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  52.11 
 
 		 480 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  51.88 
 
 		 480 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  51.88 
 
 		 480 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  50.22 
 
 		 472 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  50.44 
 
 		 475 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  50.44 
 
 		 475 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  50 
 
 		 472 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  50.67 
 
 		 456 aa  480  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  50.88 
 
 		 478 aa  481  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  51.43 
 
 		 465 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  51.11 
 
 		 465 aa  468  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  47.07 
 
 		 460 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  50.45 
 
 		 463 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  49.66 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  46.85 
 
 		 460 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2871  putative aminotransferase  46.56 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3250  putative aminotransferase  46.84 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2588  putative aminotransferase  46.84 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155274  normal  0.308476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3128  putative aminotransferase  46.84 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4932  putative aminotransferase  46.24 
 
 		 456 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  49.42 
 
 		 456 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  43.69 
 
 		 456 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  47.33 
 
 		 456 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  42.83 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  41.48 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  41.83 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  43.54 
 
 		 463 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  41.74 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  42.41 
 
 		 455 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  43.54 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  41.05 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  41.63 
 
 		 468 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  42.07 
 
 		 468 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  42.42 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  40.78 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  40.78 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  41.79 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  42.31 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  41.15 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  41.36 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  43.76 
 
 		 460 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  41.59 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  41.7 
 
 		 467 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  43.44 
 
 		 460 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  41.97 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  41.48 
 
 		 463 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  38.91 
 
 		 465 aa  362  6e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  41.96 
 
 		 458 aa  362  8e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  41.58 
 
 		 468 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  43.22 
 
 		 456 aa  361  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  42.15 
 
 		 464 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  42.38 
 
 		 464 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  40.96 
 
 		 467 aa  358  9.999999999999999e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  43.12 
 
 		 458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>