More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2904 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  87.2 
 
 		 482 aa  830    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  80.38 
 
 		 472 aa  805    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  80.79 
 
 		 472 aa  807    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  79.25 
 
 		 475 aa  792    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  79.25 
 
 		 475 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  80.38 
 
 		 472 aa  803    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  85.26 
 
 		 461 aa  821    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  94.17 
 
 		 480 aa  910    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  82.25 
 
 		 477 aa  808    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  80.92 
 
 		 476 aa  804    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  90.02 
 
 		 464 aa  835    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  95.62 
 
 		 480 aa  927    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  90.87 
 
 		 461 aa  837    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  86.31 
 
 		 481 aa  818    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  90.47 
 
 		 465 aa  832    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  100 
 
 		 477 aa  989    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  95.42 
 
 		 480 aa  927    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  97.06 
 
 		 475 aa  947    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  95.42 
 
 		 480 aa  927    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  89.58 
 
 		 464 aa  833    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  85.18 
 
 		 478 aa  837    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  80.58 
 
 		 472 aa  805    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  90.65 
 
 		 461 aa  833    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  99.16 
 
 		 477 aa  983    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  89.58 
 
 		 464 aa  833    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  59.47 
 
 		 460 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  60.39 
 
 		 464 aa  568  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  59.24 
 
 		 455 aa  568  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  59.2 
 
 		 457 aa  569  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  59.69 
 
 		 460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  57.21 
 
 		 454 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  57.05 
 
 		 454 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  57.37 
 
 		 455 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  58.35 
 
 		 457 aa  549  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  56.51 
 
 		 460 aa  551  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  58.3 
 
 		 456 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2871  putative aminotransferase  59.03 
 
 		 460 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  58.3 
 
 		 456 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  56.85 
 
 		 453 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4932  putative aminotransferase  59.78 
 
 		 456 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  57.75 
 
 		 453 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  57.3 
 
 		 453 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  55.97 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  57.53 
 
 		 453 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  56.98 
 
 		 452 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  56.76 
 
 		 452 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  56.76 
 
 		 452 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  56.05 
 
 		 451 aa  531  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  57.52 
 
 		 463 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  55.31 
 
 		 470 aa  528  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  57.44 
 
 		 456 aa  528  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2588  putative aminotransferase  58.94 
 
 		 460 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155274  normal  0.308476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3250  putative aminotransferase  58.94 
 
 		 460 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3128  putative aminotransferase  58.94 
 
 		 460 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  55.78 
 
 		 459 aa  521  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  55.41 
 
 		 455 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  51.19 
 
 		 460 aa  498  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  53.68 
 
 		 478 aa  499  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  53.52 
 
 		 471 aa  500  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  54.28 
 
 		 455 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  54.44 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  53.3 
 
 		 478 aa  491  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  50.99 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  51.98 
 
 		 465 aa  465  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  50.34 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  51.55 
 
 		 465 aa  460  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  41.43 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  40.98 
 
 		 456 aa  362  7.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  40.36 
 
 		 456 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  40.82 
 
 		 456 aa  358  8e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  43.3 
 
 		 468 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  42.04 
 
 		 469 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  41.22 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  40.9 
 
 		 463 aa  348  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  39.2 
 
 		 456 aa  348  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  40.67 
 
 		 485 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  41.56 
 
 		 467 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  40.18 
 
 		 456 aa  346  6e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  41.22 
 
 		 460 aa  345  7e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  39.96 
 
 		 456 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  41.24 
 
 		 455 aa  344  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  41.24 
 
 		 458 aa  343  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  39.91 
 
 		 459 aa  343  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  40.67 
 
 		 463 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  39.57 
 
 		 468 aa  342  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  40.77 
 
 		 468 aa  338  9e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  43.25 
 
 		 459 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  39.28 
 
 		 461 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  40.31 
 
 		 465 aa  334  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  37.58 
 
 		 467 aa  333  4e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  39.22 
 
 		 463 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  42.13 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  41.91 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  41.91 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  38.99 
 
 		 460 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  39.22 
 
 		 467 aa  329  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  41.69 
 
 		 464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  40.22 
 
 		 463 aa  326  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  38.33 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  39.51 
 
 		 465 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>