More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2054 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  971    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  53.81 
 
 		 463 aa  518  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  53.85 
 
 		 465 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  50.98 
 
 		 470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  50.55 
 
 		 470 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  50.33 
 
 		 470 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  48.26 
 
 		 468 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0847  hypothetical protein  46.34 
 
 		 473 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1450  hypothetical protein  46.34 
 
 		 473 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235478  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2163  hypothetical protein  46.34 
 
 		 473 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000327141  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2091  hypothetical protein  44.81 
 
 		 473 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0436  hypothetical protein  46.34 
 
 		 473 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0532  hypothetical protein  46.34 
 
 		 473 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601876  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1858  hypothetical protein  46.12 
 
 		 473 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000249145  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3177  hypothetical protein  41.65 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.060239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2835  hypothetical protein  41.88 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.561415  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3534  hypothetical protein  42.25 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.631271  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  40.56 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  41.48 
 
 		 451 aa  363  4e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  38.16 
 
 		 456 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  40.71 
 
 		 463 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  40.49 
 
 		 466 aa  361  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  41.45 
 
 		 451 aa  358  9e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  39.78 
 
 		 460 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  40.96 
 
 		 460 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  40.26 
 
 		 467 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  37.99 
 
 		 459 aa  355  6.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  40.36 
 
 		 454 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  40.27 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  40.58 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  39.33 
 
 		 460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  38.29 
 
 		 463 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  39.6 
 
 		 456 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  39.6 
 
 		 456 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  41.72 
 
 		 455 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  42.33 
 
 		 454 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  39.73 
 
 		 457 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  39.11 
 
 		 468 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  40.72 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  39.54 
 
 		 455 aa  348  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  39.68 
 
 		 450 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  38.53 
 
 		 459 aa  347  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  39.28 
 
 		 456 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  39.33 
 
 		 463 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  40.96 
 
 		 453 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  38.7 
 
 		 461 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  39 
 
 		 457 aa  346  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  40.49 
 
 		 453 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  37.53 
 
 		 470 aa  345  7e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  38.58 
 
 		 452 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  38.37 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  39.4 
 
 		 452 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  38.99 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  40.49 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  38.94 
 
 		 461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  38.43 
 
 		 469 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  38.51 
 
 		 456 aa  342  8e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  38.48 
 
 		 458 aa  341  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  39.74 
 
 		 466 aa  341  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  38.14 
 
 		 452 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  39.42 
 
 		 478 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  38.04 
 
 		 461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  36.36 
 
 		 456 aa  340  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  38.94 
 
 		 478 aa  339  7e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  37.47 
 
 		 464 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  38.14 
 
 		 465 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  38.48 
 
 		 482 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  39.38 
 
 		 464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  37.31 
 
 		 465 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  39.38 
 
 		 464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  37.93 
 
 		 471 aa  336  5e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  37.47 
 
 		 464 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  37.47 
 
 		 464 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  37.85 
 
 		 468 aa  336  7e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  39.38 
 
 		 464 aa  336  7e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  41.01 
 
 		 465 aa  335  7e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  38.53 
 
 		 468 aa  336  7e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  36.92 
 
 		 457 aa  335  7.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  38.7 
 
 		 481 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  40.79 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  37.28 
 
 		 461 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  37.2 
 
 		 465 aa  333  5e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  37.36 
 
 		 456 aa  332  7.000000000000001e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  38.43 
 
 		 464 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  38.04 
 
 		 472 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  41.08 
 
 		 464 aa  332  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  38.04 
 
 		 472 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  41.03 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  38.5 
 
 		 463 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  38.21 
 
 		 464 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  38.72 
 
 		 485 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  39.42 
 
 		 459 aa  330  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  38.27 
 
 		 464 aa  330  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  37.81 
 
 		 472 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  37.81 
 
 		 456 aa  330  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  37.17 
 
 		 460 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  38.5 
 
 		 477 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  38.5 
 
 		 476 aa  329  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  38.7 
 
 		 465 aa  329  6e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  36.36 
 
 		 456 aa  329  6e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>