More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2631 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  100 
 
 		 451 aa  922    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  78.25 
 
 		 451 aa  740    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  50 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  50.23 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  48.78 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  45.74 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  46.33 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  45.84 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  45.17 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  41.8 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  44.62 
 
 		 463 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  44.1 
 
 		 443 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  46.74 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  43.98 
 
 		 467 aa  362  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  44.37 
 
 		 456 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  44.32 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  45.96 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  44.47 
 
 		 466 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  43.59 
 
 		 456 aa  356  5.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  43.17 
 
 		 465 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  40.27 
 
 		 467 aa  354  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  42.89 
 
 		 453 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  42.86 
 
 		 459 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  41.5 
 
 		 460 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  43.21 
 
 		 471 aa  350  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  40.86 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  43.02 
 
 		 454 aa  349  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  43.69 
 
 		 456 aa  349  5e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  42.66 
 
 		 453 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  43.16 
 
 		 452 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  43.42 
 
 		 457 aa  349  6e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  42.79 
 
 		 452 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  43.54 
 
 		 463 aa  349  7e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  41.5 
 
 		 460 aa  349  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  44.95 
 
 		 457 aa  349  7e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  42.66 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  43.47 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  42.95 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  42.43 
 
 		 453 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  44.16 
 
 		 455 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  42.44 
 
 		 469 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  41.49 
 
 		 485 aa  346  5e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  43.31 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  43.99 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  42.34 
 
 		 452 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  43.24 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  41.12 
 
 		 460 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  42.76 
 
 		 463 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  42.14 
 
 		 456 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  42.14 
 
 		 456 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  42.51 
 
 		 456 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  41.32 
 
 		 446 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  42.44 
 
 		 465 aa  340  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  41.41 
 
 		 455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  41.94 
 
 		 468 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  41.65 
 
 		 470 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  40.87 
 
 		 446 aa  338  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  43.18 
 
 		 457 aa  339  8e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  41.22 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  41.45 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  40.98 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  40.98 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  40.98 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  40.98 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  40.98 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  40.87 
 
 		 446 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  42.86 
 
 		 459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  41.22 
 
 		 449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  42.89 
 
 		 458 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  42.76 
 
 		 454 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  41.65 
 
 		 470 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  40.41 
 
 		 446 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  40.41 
 
 		 446 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  40.41 
 
 		 446 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  41.65 
 
 		 470 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  43.54 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  42.04 
 
 		 468 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  42.21 
 
 		 470 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  41.38 
 
 		 456 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  42.29 
 
 		 456 aa  333  5e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  40.87 
 
 		 446 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  42.32 
 
 		 463 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  41.14 
 
 		 450 aa  332  9e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  40.05 
 
 		 461 aa  332  9e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  41.12 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  41.42 
 
 		 456 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  41.19 
 
 		 457 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  41.41 
 
 		 457 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  39.09 
 
 		 465 aa  329  7e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  41.81 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  41.28 
 
 		 464 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  42.51 
 
 		 465 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  41.28 
 
 		 464 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  41.63 
 
 		 459 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  40.45 
 
 		 468 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  41.81 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  42.45 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  41.23 
 
 		 464 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  39.82 
 
 		 478 aa  323  5e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  41.06 
 
 		 459 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>