More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0371 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  100 
 
 		 452 aa  918    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  55.08 
 
 		 449 aa  490  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  54.83 
 
 		 454 aa  481  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  54.93 
 
 		 450 aa  478  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  46.95 
 
 		 451 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  46.33 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  38.77 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  41.51 
 
 		 460 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  38.67 
 
 		 456 aa  316  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  40.49 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  42.08 
 
 		 446 aa  312  9e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  41.37 
 
 		 446 aa  309  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  41.84 
 
 		 449 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  41.84 
 
 		 449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  41.84 
 
 		 449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  42.08 
 
 		 449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  41.84 
 
 		 449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  40.23 
 
 		 479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  41.84 
 
 		 449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  41.84 
 
 		 449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  41.43 
 
 		 446 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  41.84 
 
 		 449 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  41.51 
 
 		 446 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  41.51 
 
 		 446 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  41.51 
 
 		 446 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  41.04 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  41.27 
 
 		 459 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  43.97 
 
 		 459 aa  299  7e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  39.28 
 
 		 466 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  41.35 
 
 		 466 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  41.45 
 
 		 456 aa  296  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  39.46 
 
 		 471 aa  296  7e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  41.83 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  41.94 
 
 		 454 aa  295  1e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  41.57 
 
 		 466 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  39.69 
 
 		 465 aa  295  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  41.57 
 
 		 466 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  40.9 
 
 		 466 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  38.84 
 
 		 453 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  40.63 
 
 		 466 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  38.84 
 
 		 453 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  39.41 
 
 		 451 aa  293  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  38.9 
 
 		 455 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  40.29 
 
 		 457 aa  293  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  39.47 
 
 		 465 aa  292  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  39.13 
 
 		 457 aa  292  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  41.35 
 
 		 466 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  43.53 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  37.67 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  38.62 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  44.34 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  38.62 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  38.62 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  38.51 
 
 		 455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  38.99 
 
 		 457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  38.62 
 
 		 453 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  40.82 
 
 		 448 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5008  hypothetical protein  40.91 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375016 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  40.82 
 
 		 448 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  40.82 
 
 		 448 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  39.19 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  38.37 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  39.19 
 
 		 456 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  38.98 
 
 		 461 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  40 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  38.91 
 
 		 456 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  39.08 
 
 		 454 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  39.42 
 
 		 461 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  39.42 
 
 		 461 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  41.19 
 
 		 456 aa  286  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  41.08 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  39.33 
 
 		 460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  39.33 
 
 		 460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  41.33 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  38.2 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  37.17 
 
 		 449 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  39.86 
 
 		 458 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  39.29 
 
 		 461 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  39.77 
 
 		 458 aa  283  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  38.24 
 
 		 467 aa  283  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  40.86 
 
 		 457 aa  283  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  37.39 
 
 		 458 aa  282  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  38.22 
 
 		 457 aa  283  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  40.62 
 
 		 468 aa  282  9e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  39.07 
 
 		 469 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  37.31 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  40.54 
 
 		 460 aa  281  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4964  hypothetical protein  42.7 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0693089  normal  0.0526808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  40.41 
 
 		 463 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  41.48 
 
 		 464 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  40.14 
 
 		 448 aa  279  7e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  38.3 
 
 		 452 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  37.35 
 
 		 450 aa  279  8e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  38.12 
 
 		 455 aa  279  8e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  37.78 
 
 		 460 aa  279  8e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  40.41 
 
 		 462 aa  279  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  40.72 
 
 		 463 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  41.06 
 
 		 463 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  40.71 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  40.72 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>