More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1771 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  84.68 
 
 		 461 aa  781    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  80.93 
 
 		 438 aa  693    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  73.86 
 
 		 464 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  81.26 
 
 		 462 aa  761    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  74.1 
 
 		 460 aa  650    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  76.47 
 
 		 458 aa  669    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  71.78 
 
 		 468 aa  644    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  73.42 
 
 		 458 aa  658    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  80.48 
 
 		 461 aa  744    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  100 
 
 		 456 aa  929    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  72.37 
 
 		 458 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  83.78 
 
 		 461 aa  773    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  84.68 
 
 		 461 aa  781    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  71.27 
 
 		 464 aa  634    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  72.01 
 
 		 456 aa  634  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  69.91 
 
 		 457 aa  629  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  68.96 
 
 		 459 aa  621  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  67.41 
 
 		 448 aa  619  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  66.97 
 
 		 462 aa  598  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  68.17 
 
 		 448 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  64.84 
 
 		 454 aa  590  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  63.62 
 
 		 463 aa  589  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  57.46 
 
 		 460 aa  534  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  53.83 
 
 		 464 aa  468  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  49.01 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  50.24 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  45.54 
 
 		 479 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  44.86 
 
 		 465 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  44.64 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  44.78 
 
 		 465 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  45.13 
 
 		 465 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  44.57 
 
 		 465 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  44.57 
 
 		 465 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  45.77 
 
 		 462 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  41 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  40.33 
 
 		 454 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  42.49 
 
 		 451 aa  320  5e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  43.88 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  44.08 
 
 		 449 aa  315  8e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  40.66 
 
 		 455 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  40.05 
 
 		 453 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  40.24 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  40.24 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  40.05 
 
 		 454 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  42.36 
 
 		 454 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  40.05 
 
 		 457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  40.14 
 
 		 443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  40.05 
 
 		 453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  39.91 
 
 		 456 aa  306  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  41.37 
 
 		 451 aa  305  8.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  39.81 
 
 		 453 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  39.81 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  41.92 
 
 		 458 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  40.76 
 
 		 448 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  40.14 
 
 		 451 aa  300  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  40.52 
 
 		 452 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  40.74 
 
 		 470 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  40.05 
 
 		 470 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  40.52 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  40.52 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  40.05 
 
 		 470 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  38.21 
 
 		 466 aa  295  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  39.57 
 
 		 452 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  38.91 
 
 		 457 aa  294  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  38.83 
 
 		 449 aa  292  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  39.76 
 
 		 460 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  39.57 
 
 		 452 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  39.24 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  42.3 
 
 		 450 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  37.89 
 
 		 467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  37.56 
 
 		 465 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  37.94 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  41.08 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  39.91 
 
 		 464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  38.22 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  40.67 
 
 		 446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  38.39 
 
 		 463 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  37.65 
 
 		 463 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  37.39 
 
 		 468 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  40.29 
 
 		 460 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  39.39 
 
 		 466 aa  282  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  36.34 
 
 		 459 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  38.74 
 
 		 446 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  40 
 
 		 463 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  38.16 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  39 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  37.16 
 
 		 446 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  40.16 
 
 		 446 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  37.16 
 
 		 446 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  37.16 
 
 		 446 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  37.16 
 
 		 446 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  39.41 
 
 		 478 aa  279  8e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  36.14 
 
 		 459 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  37.12 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  36.05 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  36.27 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  39.26 
 
 		 467 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  37.95 
 
 		 444 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  41.25 
 
 		 449 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  39.63 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>