More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1551 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  68.22 
 
 
448 aa  640    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  71.18 
 
 
458 aa  640    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  74.13 
 
 
460 aa  694    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  78.85 
 
 
464 aa  720    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  68.35 
 
 
459 aa  643    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  70.61 
 
 
461 aa  652    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  68.46 
 
 
468 aa  647    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  72.37 
 
 
456 aa  667    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  71.62 
 
 
458 aa  645    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  71.27 
 
 
461 aa  658    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  71.27 
 
 
461 aa  658    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  71.55 
 
 
457 aa  656    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  71.68 
 
 
461 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  71.77 
 
 
462 aa  652    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  950    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  69.98 
 
 
456 aa  633  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  66.38 
 
 
462 aa  627  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  66.67 
 
 
454 aa  621  1e-177  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  68.68 
 
 
448 aa  616  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  67.85 
 
 
464 aa  612  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  65.33 
 
 
463 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  68.26 
 
 
438 aa  586  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  59.65 
 
 
460 aa  553  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  56.1 
 
 
464 aa  510  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  51.11 
 
 
478 aa  435  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  49.21 
 
 
454 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  45.55 
 
 
465 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  45.43 
 
 
465 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  46 
 
 
465 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  45.55 
 
 
465 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  45.66 
 
 
465 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  45.55 
 
 
465 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  45.3 
 
 
462 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  45.34 
 
 
479 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  40.66 
 
 
451 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  40.84 
 
 
455 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  43.54 
 
 
449 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  40.19 
 
 
455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  39.82 
 
 
451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  41.77 
 
 
470 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  39.14 
 
 
454 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  41.56 
 
 
470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  39.95 
 
 
454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  38.6 
 
 
453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  41.13 
 
 
470 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  40.57 
 
 
468 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  38.41 
 
 
452 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  41.82 
 
 
464 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  41.86 
 
 
450 aa  302  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  39.05 
 
 
452 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  38.15 
 
 
453 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  38.15 
 
 
453 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  37.69 
 
 
443 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  39.48 
 
 
453 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  36.54 
 
 
466 aa  298  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  39.86 
 
 
457 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  38.6 
 
 
452 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  38.56 
 
 
458 aa  295  8e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  36.91 
 
 
467 aa  295  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  38.85 
 
 
463 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  39.77 
 
 
463 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  39.21 
 
 
463 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  38.81 
 
 
460 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  40.27 
 
 
454 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70160  omega amino acid--pyruvate transaminase  37.17 
 
 
444 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  37.55 
 
 
459 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  37.3 
 
 
456 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  37.3 
 
 
456 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  36.27 
 
 
456 aa  293  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  40.61 
 
 
468 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  37.06 
 
 
450 aa  292  8e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  38.83 
 
 
451 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  37.22 
 
 
450 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  40.19 
 
 
448 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  37.22 
 
 
450 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  40.19 
 
 
448 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  37 
 
 
449 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  37 
 
 
449 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6089  omega amino acid--pyruvate transaminase  36.28 
 
 
444 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  39.95 
 
 
448 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  36.78 
 
 
449 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  38.28 
 
 
449 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  38.32 
 
 
457 aa  290  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  36.78 
 
 
450 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0229  beta alanine--pyruvate transaminase  38.14 
 
 
437 aa  289  8e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.946492  normal  0.224107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  36.64 
 
 
450 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  36.89 
 
 
465 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  38 
 
 
467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  36.64 
 
 
450 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  37.28 
 
 
456 aa  286  7e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  38.79 
 
 
460 aa  285  8e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  37.42 
 
 
456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  40.5 
 
 
467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  37.36 
 
 
455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  38.53 
 
 
449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  38.38 
 
 
478 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  38.18 
 
 
442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  38.84 
 
 
445 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  36.72 
 
 
457 aa  283  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3898  beta alanine--pyruvate transaminase  36.85 
 
 
444 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>