More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1929 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  67.85 
 
 		 458 aa  635    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  100 
 
 		 464 aa  948    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  69.2 
 
 		 461 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  69.2 
 
 		 461 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  75.43 
 
 		 468 aa  713    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  71.27 
 
 		 456 aa  657    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  69.35 
 
 		 462 aa  633  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  68.33 
 
 		 461 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  67.96 
 
 		 461 aa  620  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  67.34 
 
 		 459 aa  617  1e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  65.62 
 
 		 457 aa  604  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  67.34 
 
 		 460 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  64.79 
 
 		 448 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  66.96 
 
 		 458 aa  600  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  67.18 
 
 		 458 aa  599  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  67.42 
 
 		 464 aa  596  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  66.29 
 
 		 456 aa  594  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  62.61 
 
 		 463 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  64.85 
 
 		 462 aa  579  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  68.74 
 
 		 438 aa  580  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  65.24 
 
 		 448 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  62.08 
 
 		 454 aa  551  1e-156  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  54.15 
 
 		 460 aa  498  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  52.03 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  49.67 
 
 		 478 aa  417  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  49.06 
 
 		 454 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  48.02 
 
 		 465 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  47.2 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  47.18 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  47.18 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  47.18 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  46.61 
 
 		 465 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  46.65 
 
 		 462 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  43.57 
 
 		 479 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  40.79 
 
 		 448 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  40.79 
 
 		 448 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  40.56 
 
 		 448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  43.54 
 
 		 450 aa  309  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  41.69 
 
 		 451 aa  307  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  38.83 
 
 		 454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  39.05 
 
 		 455 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  40.81 
 
 		 455 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  39.12 
 
 		 454 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  42.42 
 
 		 454 aa  303  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  40.71 
 
 		 453 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  40.86 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  41.59 
 
 		 449 aa  299  9e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  40.48 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  39.69 
 
 		 452 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  40.97 
 
 		 451 aa  297  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  38.96 
 
 		 453 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  40.14 
 
 		 453 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  39.1 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  38.34 
 
 		 456 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  40.47 
 
 		 460 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  40.15 
 
 		 466 aa  293  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  40.71 
 
 		 458 aa  293  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  40.85 
 
 		 457 aa  293  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  40.27 
 
 		 464 aa  290  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  38.61 
 
 		 446 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  38.61 
 
 		 446 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  38.61 
 
 		 446 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  38.95 
 
 		 452 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  38.85 
 
 		 449 aa  289  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  38.85 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  37.33 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  38.85 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  39.09 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  38.85 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  38.85 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  38.85 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  37.33 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  37.83 
 
 		 471 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  38.13 
 
 		 446 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  37.62 
 
 		 443 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  39.26 
 
 		 456 aa  286  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  38.72 
 
 		 446 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  38.61 
 
 		 449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  38.86 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  38.02 
 
 		 452 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  41.1 
 
 		 446 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  41.1 
 
 		 446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  37.95 
 
 		 450 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  38.36 
 
 		 459 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  40.42 
 
 		 478 aa  283  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  37.99 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  38.68 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  37.67 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3534  hypothetical protein  38.31 
 
 		 467 aa  280  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.631271  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  38.48 
 
 		 447 aa  280  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3177  hypothetical protein  37.86 
 
 		 467 aa  279  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.060239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  37.53 
 
 		 459 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  38.83 
 
 		 478 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  37.31 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  39.08 
 
 		 470 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  39.77 
 
 		 466 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  37.67 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  38.85 
 
 		 470 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  37.24 
 
 		 465 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  39.58 
 
 		 470 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>