More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0278 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  66.38 
 
 		 458 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  74 
 
 		 458 aa  688    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  948    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  67.63 
 
 		 454 aa  644    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  68.09 
 
 		 448 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  68.43 
 
 		 464 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  69.57 
 
 		 456 aa  643    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  70.87 
 
 		 460 aa  669    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  69.87 
 
 		 459 aa  686    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  67.95 
 
 		 448 aa  629  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  65.95 
 
 		 462 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  65.71 
 
 		 458 aa  607  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  65.84 
 
 		 457 aa  608  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  66.97 
 
 		 456 aa  608  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  65.25 
 
 		 461 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  65.25 
 
 		 461 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  64.35 
 
 		 461 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  63.18 
 
 		 461 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  60.83 
 
 		 463 aa  580  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  59.09 
 
 		 460 aa  573  1.0000000000000001e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  64.85 
 
 		 464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  62.36 
 
 		 468 aa  571  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  64.61 
 
 		 438 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  57.37 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  50.33 
 
 		 465 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  51.67 
 
 		 478 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  49.78 
 
 		 465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  49.89 
 
 		 465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  49.78 
 
 		 465 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  52.09 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  50.66 
 
 		 454 aa  445  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  49.89 
 
 		 465 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  49.78 
 
 		 465 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  45.92 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  38.84 
 
 		 456 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  38.84 
 
 		 456 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  39.15 
 
 		 454 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  39.37 
 
 		 455 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  38.57 
 
 		 454 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  42.5 
 
 		 451 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  38.85 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  42.46 
 
 		 456 aa  319  6e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  37.83 
 
 		 452 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  37.22 
 
 		 453 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  38.88 
 
 		 457 aa  312  9e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  37.83 
 
 		 452 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  45.7 
 
 		 448 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  45.7 
 
 		 448 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  37.53 
 
 		 466 aa  310  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  45.7 
 
 		 448 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  37.39 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  37 
 
 		 453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  38.04 
 
 		 443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  39.58 
 
 		 457 aa  306  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  41.83 
 
 		 449 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  36.77 
 
 		 453 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  36.77 
 
 		 453 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  37.69 
 
 		 471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  39.34 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  40.97 
 
 		 478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  39.65 
 
 		 457 aa  302  9e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  37.56 
 
 		 451 aa  302  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  43.23 
 
 		 450 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  39.55 
 
 		 464 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  37.95 
 
 		 470 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  38.01 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  39.91 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  36.62 
 
 		 459 aa  297  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  41.43 
 
 		 450 aa  296  5e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  38.31 
 
 		 449 aa  295  8e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  37.15 
 
 		 463 aa  295  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  39.91 
 
 		 470 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  42.01 
 
 		 463 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  38.73 
 
 		 466 aa  293  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1190  aminotransferase class-III  42.32 
 
 		 417 aa  293  6e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.429326  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  38.19 
 
 		 467 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  37.37 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3177  hypothetical protein  37.88 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.060239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  37.87 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3534  hypothetical protein  38.31 
 
 		 467 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.631271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4941  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  38.48 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  39.35 
 
 		 451 aa  290  5.0000000000000004e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  41.3 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2835  hypothetical protein  38.93 
 
 		 467 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.561415  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  42.11 
 
 		 449 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  35.53 
 
 		 456 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5404  aminotransferase class-III  38.53 
 
 		 435 aa  286  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254649  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  38.63 
 
 		 460 aa  286  8e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1580  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  39.69 
 
 		 455 aa  285  9e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  40.97 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  38.26 
 
 		 447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  37.8 
 
 		 463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  41.55 
 
 		 449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  41.55 
 
 		 449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  41.55 
 
 		 449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  41.55 
 
 		 449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  38.02 
 
 		 454 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  41.55 
 
 		 449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  41.55 
 
 		 449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0229  beta alanine--pyruvate transaminase  39 
 
 		 437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.946492  normal  0.224107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>