More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1493 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  72.22 
 
 
457 aa  670    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  69.27 
 
 
448 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  71.18 
 
 
458 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  72.05 
 
 
458 aa  663    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  76.47 
 
 
456 aa  696    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  74.13 
 
 
462 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  74.45 
 
 
461 aa  702    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  100 
 
 
458 aa  931    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  73.94 
 
 
461 aa  676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  71.93 
 
 
460 aa  668    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  73.58 
 
 
461 aa  695    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  71.27 
 
 
464 aa  665    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  74.45 
 
 
461 aa  702    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  67.83 
 
 
459 aa  637    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  70.56 
 
 
456 aa  632  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  72.52 
 
 
438 aa  625  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  65.71 
 
 
462 aa  620  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  69.59 
 
 
448 aa  619  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  66.59 
 
 
468 aa  616  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  66.96 
 
 
454 aa  615  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  67.77 
 
 
464 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  63.7 
 
 
463 aa  595  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  57.88 
 
 
460 aa  537  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  54.97 
 
 
464 aa  495  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  49.89 
 
 
478 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  50.11 
 
 
454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  45.54 
 
 
479 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  45.67 
 
 
462 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  44.05 
 
 
465 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  44.27 
 
 
465 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  44.05 
 
 
465 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  43.61 
 
 
465 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  43.61 
 
 
465 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  43.61 
 
 
465 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  39.35 
 
 
455 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  38.63 
 
 
454 aa  319  5e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  41.86 
 
 
451 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  38.5 
 
 
455 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  38.33 
 
 
457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  37.92 
 
 
453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  37.53 
 
 
454 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  37.83 
 
 
456 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  37.83 
 
 
456 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  43.36 
 
 
450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  43.88 
 
 
449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  37.83 
 
 
453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  36.66 
 
 
466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  41.19 
 
 
464 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  40.04 
 
 
456 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  37.39 
 
 
453 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  37.39 
 
 
453 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  37.58 
 
 
470 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  36.92 
 
 
470 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  42.02 
 
 
454 aa  297  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  37.17 
 
 
470 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  37.73 
 
 
443 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  39.57 
 
 
458 aa  296  5e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  37.39 
 
 
452 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  38.94 
 
 
450 aa  293  6e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  38.26 
 
 
449 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  37.16 
 
 
452 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  36.89 
 
 
466 aa  290  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  39.53 
 
 
451 aa  290  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  39.66 
 
 
460 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  42.42 
 
 
452 aa  289  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  40.04 
 
 
444 aa  289  8e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  38.44 
 
 
457 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  39.63 
 
 
478 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  40.14 
 
 
444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  36.71 
 
 
452 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  40.22 
 
 
457 aa  286  7e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  38.16 
 
 
471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  37.79 
 
 
451 aa  284  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  38.23 
 
 
459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  41.8 
 
 
448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  42.41 
 
 
442 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2100  aminotransferase class-III  43.29 
 
 
461 aa  282  7.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  41.8 
 
 
448 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  41.8 
 
 
448 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  39.44 
 
 
457 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  41.96 
 
 
442 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  40.83 
 
 
450 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  37.1 
 
 
460 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  36.73 
 
 
468 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4964  hypothetical protein  41.78 
 
 
458 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0693089  normal  0.0526808 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4413  hypothetical protein  40.56 
 
 
458 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  39.12 
 
 
456 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  40.44 
 
 
446 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  38.26 
 
 
465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  37.08 
 
 
446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  38 
 
 
449 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5008  hypothetical protein  39.44 
 
 
458 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.375016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  37.08 
 
 
446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  37.08 
 
 
446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  37.69 
 
 
470 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  37.08 
 
 
446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  39.62 
 
 
446 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  41.07 
 
 
442 aa  272  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  35.44 
 
 
467 aa  273  7e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  36.84 
 
 
456 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>