More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2100 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2100  aminotransferase class-III  100 
 
 
461 aa  937    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4941  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  56.72 
 
 
452 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  43.32 
 
 
458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  41.63 
 
 
450 aa  319  7.999999999999999e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  40.81 
 
 
454 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  38.17 
 
 
471 aa  315  8e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  40.23 
 
 
449 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  41.9 
 
 
448 aa  309  6.999999999999999e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  42.04 
 
 
459 aa  309  8e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  39.26 
 
 
455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  37.1 
 
 
466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  39.45 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  38.37 
 
 
460 aa  305  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  37.75 
 
 
443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  38.29 
 
 
457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  39.6 
 
 
454 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  40.44 
 
 
451 aa  302  8.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  38.48 
 
 
457 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  37.61 
 
 
478 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  38.05 
 
 
456 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  38.05 
 
 
456 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  39.37 
 
 
461 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  39.14 
 
 
461 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  37.73 
 
 
454 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  36.84 
 
 
460 aa  297  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  38.77 
 
 
464 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  37.5 
 
 
455 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  36.95 
 
 
464 aa  295  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  38.11 
 
 
464 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  38.5 
 
 
465 aa  294  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  38.11 
 
 
464 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  39.86 
 
 
458 aa  293  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  38.9 
 
 
465 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  38.07 
 
 
461 aa  293  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  38.07 
 
 
461 aa  292  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  38.07 
 
 
461 aa  292  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  38.46 
 
 
461 aa  292  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  36.54 
 
 
454 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  35.94 
 
 
451 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  36.69 
 
 
456 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  38.31 
 
 
479 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  36.17 
 
 
470 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  36.2 
 
 
459 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  38.16 
 
 
452 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  36.43 
 
 
453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  36.78 
 
 
458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  36.11 
 
 
453 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  36.61 
 
 
453 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  38.78 
 
 
461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  36.16 
 
 
453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  37.47 
 
 
452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  45.68 
 
 
448 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  40 
 
 
460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  37.28 
 
 
457 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  39.29 
 
 
456 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  36.64 
 
 
466 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  38.74 
 
 
451 aa  283  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  39.26 
 
 
452 aa  283  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  37.78 
 
 
462 aa  282  9e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  38.71 
 
 
480 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  38.46 
 
 
477 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  38.71 
 
 
480 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  38.76 
 
 
463 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  38.71 
 
 
480 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  38.12 
 
 
472 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  37.47 
 
 
472 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  38.24 
 
 
477 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  37.13 
 
 
472 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  37.09 
 
 
456 aa  280  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  36.78 
 
 
478 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  39.26 
 
 
464 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  37.64 
 
 
475 aa  279  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  39.32 
 
 
466 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  37.5 
 
 
478 aa  279  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  35.29 
 
 
470 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  37.01 
 
 
452 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  38.65 
 
 
466 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  38.65 
 
 
466 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  37.53 
 
 
475 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  38.48 
 
 
480 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  39.41 
 
 
466 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  37.53 
 
 
475 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  42.62 
 
 
457 aa  279  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  36.87 
 
 
456 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  39.05 
 
 
462 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  37.05 
 
 
468 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  35.08 
 
 
470 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  37.61 
 
 
482 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  37.89 
 
 
472 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  39.18 
 
 
466 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  35.29 
 
 
470 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  34.73 
 
 
467 aa  277  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  37.1 
 
 
467 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  37.89 
 
 
477 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  37.89 
 
 
476 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  37.61 
 
 
481 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  36.82 
 
 
467 aa  277  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3177  hypothetical protein  35.29 
 
 
467 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.060239  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3534  hypothetical protein  35.29 
 
 
467 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.631271  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  39.12 
 
 
456 aa  276  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>