More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1583 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  100 
 
 
452 aa  914    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  59.91 
 
 
466 aa  551  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  63.18 
 
 
467 aa  551  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  62.81 
 
 
466 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  62.81 
 
 
466 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  59.24 
 
 
459 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  62.36 
 
 
466 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  62.36 
 
 
466 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  62.36 
 
 
466 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  61.02 
 
 
466 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  60.49 
 
 
457 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2912  hypothetical protein  61.83 
 
 
457 aa  531  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  63 
 
 
469 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  58.48 
 
 
458 aa  531  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  61.42 
 
 
465 aa  528  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5008  hypothetical protein  59.15 
 
 
458 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.375016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  61.11 
 
 
465 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  56.38 
 
 
458 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0052  hypothetical protein  57.81 
 
 
461 aa  521  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4413  hypothetical protein  58.48 
 
 
458 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2181  hypothetical protein  59.15 
 
 
467 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4964  hypothetical protein  61.88 
 
 
458 aa  514  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0693089  normal  0.0526808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1920  hypothetical protein  59.24 
 
 
458 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  39.91 
 
 
466 aa  346  4e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  41.42 
 
 
460 aa  343  4e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  42.07 
 
 
455 aa  343  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  42.33 
 
 
452 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  42.43 
 
 
457 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  42.33 
 
 
452 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  41.26 
 
 
452 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  41.4 
 
 
453 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  41.4 
 
 
453 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  41.28 
 
 
454 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  41.18 
 
 
453 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  40.27 
 
 
453 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  38.16 
 
 
451 aa  325  7e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  37.31 
 
 
468 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  39.68 
 
 
455 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  43.12 
 
 
458 aa  325  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  39.27 
 
 
460 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  40.4 
 
 
455 aa  323  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  41.61 
 
 
457 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  39.14 
 
 
454 aa  322  8e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  39.29 
 
 
460 aa  322  9.000000000000001e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  40.05 
 
 
456 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  38.96 
 
 
463 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  39.33 
 
 
470 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  40.05 
 
 
456 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  39.11 
 
 
470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  39.33 
 
 
470 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  40.54 
 
 
456 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  38.08 
 
 
459 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  40.09 
 
 
456 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  40.94 
 
 
460 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  39.19 
 
 
471 aa  320  3e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  37.92 
 
 
465 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  39.95 
 
 
463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  39.95 
 
 
460 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  38.36 
 
 
469 aa  318  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  39.64 
 
 
457 aa  318  9e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  38.02 
 
 
457 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  39.11 
 
 
464 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  39.11 
 
 
464 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  40.49 
 
 
460 aa  316  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  40.18 
 
 
457 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  38.46 
 
 
460 aa  315  8e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  39.27 
 
 
485 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  39.11 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  38.07 
 
 
458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  38.43 
 
 
457 aa  312  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  37.83 
 
 
443 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  38.67 
 
 
464 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  39.55 
 
 
455 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  39.95 
 
 
463 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  38.44 
 
 
464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  38.67 
 
 
464 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  37.39 
 
 
461 aa  310  4e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  37.03 
 
 
463 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  39.82 
 
 
468 aa  309  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  38.65 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  36.04 
 
 
467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  38.72 
 
 
459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  37.67 
 
 
467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  39.91 
 
 
455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  37.72 
 
 
459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  37.53 
 
 
465 aa  306  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  37.72 
 
 
459 aa  306  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2091  hypothetical protein  41.35 
 
 
473 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  38.95 
 
 
465 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  38.24 
 
 
470 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  38.69 
 
 
462 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  36.65 
 
 
463 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  40.09 
 
 
449 aa  300  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  38.41 
 
 
459 aa  300  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  36.1 
 
 
467 aa  299  7e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  37.96 
 
 
456 aa  299  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  39.23 
 
 
458 aa  299  8e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1450  hypothetical protein  40.95 
 
 
473 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235478  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0847  hypothetical protein  40.95 
 
 
473 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2163  hypothetical protein  40.95 
 
 
473 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000327141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>