More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5629 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  68.34 
 
 		 459 aa  655    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2181  hypothetical protein  81.55 
 
 		 467 aa  775    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  72.11 
 
 		 466 aa  662    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0052  hypothetical protein  79.34 
 
 		 461 aa  736    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  71.96 
 
 		 465 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  74.45 
 
 		 466 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  71.96 
 
 		 465 aa  653    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  71.96 
 
 		 466 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  71.96 
 
 		 466 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  72.17 
 
 		 466 aa  653    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  944    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  72.33 
 
 		 466 aa  663    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  73.11 
 
 		 469 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  64.35 
 
 		 466 aa  604  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  63.18 
 
 		 452 aa  551  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  61.01 
 
 		 457 aa  541  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  56.86 
 
 		 458 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  58.24 
 
 		 458 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2912  hypothetical protein  62.56 
 
 		 457 aa  524  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4413  hypothetical protein  59.34 
 
 		 458 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5008  hypothetical protein  59.65 
 
 		 458 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375016 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4964  hypothetical protein  61.1 
 
 		 458 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0693089  normal  0.0526808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1920  hypothetical protein  59.12 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  43.02 
 
 		 463 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  40.89 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  42.38 
 
 		 456 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  42.02 
 
 		 466 aa  351  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  41.48 
 
 		 455 aa  351  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  40.75 
 
 		 460 aa  346  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  40.7 
 
 		 457 aa  345  7e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  39.62 
 
 		 470 aa  342  7e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  41.56 
 
 		 460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  40.31 
 
 		 457 aa  340  4e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  41.33 
 
 		 468 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  40.26 
 
 		 453 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  40.44 
 
 		 453 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  39.96 
 
 		 453 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  40.22 
 
 		 453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  41.67 
 
 		 460 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  41.5 
 
 		 464 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  40.32 
 
 		 456 aa  335  7e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  41.24 
 
 		 465 aa  335  9e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  40.99 
 
 		 463 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  40.92 
 
 		 457 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  38.9 
 
 		 454 aa  333  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  41.06 
 
 		 464 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  41.06 
 
 		 464 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  38.9 
 
 		 460 aa  332  7.000000000000001e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  39.12 
 
 		 455 aa  332  9e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  41.28 
 
 		 464 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  40.36 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  39.32 
 
 		 461 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  41.06 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  41.06 
 
 		 464 aa  330  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  39.09 
 
 		 455 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  38.85 
 
 		 454 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  39.51 
 
 		 460 aa  326  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  40.13 
 
 		 457 aa  326  6e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  40.54 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  39.39 
 
 		 457 aa  324  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  38.46 
 
 		 456 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  39.55 
 
 		 469 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  38.46 
 
 		 456 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  39.56 
 
 		 457 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  41.65 
 
 		 458 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  39.2 
 
 		 467 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  40.54 
 
 		 463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  37.67 
 
 		 443 aa  320  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  39.02 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  38.17 
 
 		 465 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  38.69 
 
 		 451 aa  317  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  39.43 
 
 		 459 aa  317  4e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  38.36 
 
 		 470 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  39.21 
 
 		 460 aa  316  5e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  37.19 
 
 		 461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  37.83 
 
 		 456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  38.36 
 
 		 470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  37.96 
 
 		 467 aa  314  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  38.65 
 
 		 458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  39.06 
 
 		 452 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  37.47 
 
 		 467 aa  312  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  38.78 
 
 		 458 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  38.68 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  38.62 
 
 		 452 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  39 
 
 		 459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  40.5 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  36.81 
 
 		 463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  38.51 
 
 		 459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  38.05 
 
 		 456 aa  307  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  38.05 
 
 		 456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  38.7 
 
 		 452 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  36.91 
 
 		 465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  38.29 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  36.61 
 
 		 468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  38.95 
 
 		 459 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  37.92 
 
 		 451 aa  303  5.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  39.78 
 
 		 455 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  34.83 
 
 		 471 aa  302  7.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  38.57 
 
 		 463 aa  302  8.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  38.46 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>