More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2285 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  89.2 
 
 		 463 aa  861    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  79.43 
 
 		 467 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  74.83 
 
 		 467 aa  709    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  947    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  61.47 
 
 		 468 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  58.06 
 
 		 465 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  58.04 
 
 		 468 aa  537  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  57.4 
 
 		 465 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  57.11 
 
 		 469 aa  531  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  57.14 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  57.14 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  57.14 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  57.8 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  57.8 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  57.49 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  55.43 
 
 		 457 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  54.99 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  54.77 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  57.05 
 
 		 459 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  54.1 
 
 		 458 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  52.98 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  52.85 
 
 		 457 aa  491  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  53.19 
 
 		 459 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  52.42 
 
 		 459 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  51.42 
 
 		 460 aa  467  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  46.21 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  45.66 
 
 		 456 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  44.59 
 
 		 456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  44.87 
 
 		 456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  44.57 
 
 		 456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  44.81 
 
 		 456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  44.54 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  44.74 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  44.74 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  43.12 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  43.15 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  44.94 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  45.19 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  43.05 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  44.39 
 
 		 460 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  43.27 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  44.39 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  42.6 
 
 		 485 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  43.69 
 
 		 458 aa  375  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  43.05 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  44.62 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  43.05 
 
 		 463 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  44.93 
 
 		 450 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  42 
 
 		 449 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  40.63 
 
 		 459 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  42.5 
 
 		 451 aa  351  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  40.09 
 
 		 466 aa  348  8e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  39.33 
 
 		 467 aa  346  5e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  41.93 
 
 		 454 aa  342  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  40.55 
 
 		 460 aa  342  9e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  41.05 
 
 		 460 aa  340  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4250  aminotransferase  39.38 
 
 		 457 aa  340  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.533724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  40.79 
 
 		 455 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3984  aminotransferase class-III  40.71 
 
 		 453 aa  335  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319262  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  40.04 
 
 		 458 aa  333  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  42.32 
 
 		 451 aa  332  8e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  39.57 
 
 		 443 aa  332  8e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2033  aminotransferase class-III  39.23 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  39.96 
 
 		 457 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0857  aminotransferase class-III  39.34 
 
 		 455 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0379  aminotransferase  39.23 
 
 		 455 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.996959  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  43.96 
 
 		 451 aa  329  6e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  41.86 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  41.1 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  40.53 
 
 		 475 aa  322  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  40.64 
 
 		 457 aa  322  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  39.41 
 
 		 465 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  39.73 
 
 		 454 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  36.65 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  40.41 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  39.46 
 
 		 455 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  39.87 
 
 		 480 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  40.31 
 
 		 480 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  39.87 
 
 		 480 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  39.87 
 
 		 480 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  39.87 
 
 		 477 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 453 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 453 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  40.09 
 
 		 461 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  40.09 
 
 		 461 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  39.65 
 
 		 477 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  39.57 
 
 		 452 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  39.86 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  40.54 
 
 		 464 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  38.99 
 
 		 482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  38.38 
 
 		 455 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  39.87 
 
 		 452 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  39.65 
 
 		 481 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  38.5 
 
 		 456 aa  312  6.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  39.42 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  39.86 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  39.86 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  39.14 
 
 		 452 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  36.73 
 
 		 459 aa  309  5.9999999999999995e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  41.16 
 
 		 450 aa  309  8e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>