More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3052 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  100 
 
 		 463 aa  931    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  53.85 
 
 		 456 aa  487  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  52.39 
 
 		 456 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  47.86 
 
 		 456 aa  435  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  47.02 
 
 		 455 aa  435  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  48.31 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  48.08 
 
 		 456 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  47.22 
 
 		 461 aa  428  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  48.11 
 
 		 460 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  48.08 
 
 		 456 aa  428  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  48.11 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  47.38 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  47.28 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  44.84 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  47.44 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9130  aminotransferase  45.03 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  45.82 
 
 		 461 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  47.38 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  45.98 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  45.76 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  47.09 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  47.22 
 
 		 468 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  45.15 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  41.74 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  42.98 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  41.59 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0857  aminotransferase class-III  42.37 
 
 		 455 aa  359  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4250  aminotransferase  42.44 
 
 		 457 aa  356  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.533724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2033  aminotransferase class-III  41.61 
 
 		 455 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0379  aminotransferase  41.61 
 
 		 455 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.996959  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  41.71 
 
 		 455 aa  353  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3984  aminotransferase class-III  40.09 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319262  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  40.64 
 
 		 450 aa  348  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  38.24 
 
 		 467 aa  346  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  41.47 
 
 		 454 aa  345  8e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  41.24 
 
 		 457 aa  343  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  38.5 
 
 		 465 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  41.47 
 
 		 455 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  38.83 
 
 		 466 aa  340  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  41.16 
 
 		 456 aa  340  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  40.32 
 
 		 454 aa  340  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  37.11 
 
 		 451 aa  338  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  40.09 
 
 		 460 aa  338  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  39.82 
 
 		 460 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  38.5 
 
 		 469 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  40.32 
 
 		 453 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  39.86 
 
 		 453 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  41.8 
 
 		 455 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  44.37 
 
 		 458 aa  335  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  39.95 
 
 		 457 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  40.76 
 
 		 466 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  39.61 
 
 		 466 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  39.61 
 
 		 466 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  39.59 
 
 		 456 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  39.59 
 
 		 456 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  39.21 
 
 		 464 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  39.21 
 
 		 464 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  40.13 
 
 		 464 aa  332  9e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  41.12 
 
 		 455 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  39.41 
 
 		 453 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  40.37 
 
 		 452 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  38.99 
 
 		 464 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  39.41 
 
 		 453 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  40.04 
 
 		 466 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  40.14 
 
 		 452 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1121  aminotransferase  40.14 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.713073  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  40 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  40.09 
 
 		 466 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  36.53 
 
 		 463 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  39.91 
 
 		 452 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  38.99 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  38.63 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  38.55 
 
 		 464 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  40.77 
 
 		 465 aa  323  4e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  36.12 
 
 		 467 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  38.06 
 
 		 456 aa  320  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  39.36 
 
 		 461 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  42.42 
 
 		 466 aa  319  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  36.65 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  37.44 
 
 		 465 aa  317  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  39.91 
 
 		 478 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  38.44 
 
 		 464 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  38.44 
 
 		 464 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  39.59 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  38.9 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  38.44 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  37.79 
 
 		 471 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  37.7 
 
 		 480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  40.09 
 
 		 451 aa  313  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  37.92 
 
 		 480 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  37.92 
 
 		 480 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  37.92 
 
 		 480 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  39.27 
 
 		 470 aa  312  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  38.78 
 
 		 463 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  37.25 
 
 		 477 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  40.63 
 
 		 451 aa  309  8e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  39.64 
 
 		 465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  37.25 
 
 		 475 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  36.79 
 
 		 477 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  38.9 
 
 		 459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>