More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3217 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  100 
 
 
449 aa  915    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  61.73 
 
 
456 aa  585  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  61.95 
 
 
456 aa  585  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  60.18 
 
 
456 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  57.3 
 
 
459 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  56.1 
 
 
460 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  56.1 
 
 
460 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  56.76 
 
 
468 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  55.93 
 
 
456 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  52.8 
 
 
463 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  51.79 
 
 
455 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  53.2 
 
 
456 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  53.17 
 
 
459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  51.77 
 
 
461 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  50.67 
 
 
458 aa  460  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  50.79 
 
 
461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  52.28 
 
 
456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  50 
 
 
463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  49.56 
 
 
485 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  49.33 
 
 
460 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  50.44 
 
 
463 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  49.67 
 
 
460 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  50.34 
 
 
462 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  47.07 
 
 
450 aa  409  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  42.98 
 
 
463 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  44.42 
 
 
464 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  44.42 
 
 
464 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0857  aminotransferase class-III  43.75 
 
 
455 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  43.98 
 
 
464 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  43.98 
 
 
464 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  43.33 
 
 
464 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  42.79 
 
 
467 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  42.22 
 
 
463 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  43.54 
 
 
464 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2033  aminotransferase class-III  42.19 
 
 
455 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  45.67 
 
 
450 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  41.52 
 
 
465 aa  365  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0379  aminotransferase  41.96 
 
 
455 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.996959  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  40.72 
 
 
469 aa  362  8e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  41.84 
 
 
463 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  41.14 
 
 
467 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  42.22 
 
 
468 aa  359  6e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  42.66 
 
 
456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  41.98 
 
 
457 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  42.7 
 
 
460 aa  355  7.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  42.32 
 
 
455 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  42.53 
 
 
468 aa  354  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  41.98 
 
 
457 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3984  aminotransferase class-III  39.73 
 
 
453 aa  353  4e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319262  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  40.18 
 
 
465 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  41.65 
 
 
455 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4250  aminotransferase  42.2 
 
 
457 aa  349  6e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.533724  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  42.6 
 
 
457 aa  348  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  43.36 
 
 
459 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  39.02 
 
 
451 aa  344  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9130  aminotransferase  40.67 
 
 
463 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1121  aminotransferase  39.64 
 
 
453 aa  344  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.713073  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  40.62 
 
 
458 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  39.96 
 
 
459 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  40.18 
 
 
460 aa  343  4e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  39.65 
 
 
455 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  40.91 
 
 
457 aa  341  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  39.74 
 
 
459 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  38.85 
 
 
453 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  39.23 
 
 
455 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  39.68 
 
 
457 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  38.31 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  38.63 
 
 
454 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  41.51 
 
 
456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  40.09 
 
 
459 aa  336  5e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  38.67 
 
 
453 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  38.03 
 
 
453 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  39.41 
 
 
456 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  39.41 
 
 
456 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  38.86 
 
 
452 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  39.64 
 
 
466 aa  334  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  38.72 
 
 
452 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  38.41 
 
 
452 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  39.64 
 
 
471 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  38.44 
 
 
454 aa  329  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  39.64 
 
 
470 aa  327  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  39.77 
 
 
460 aa  325  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  40.04 
 
 
478 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  38.29 
 
 
475 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  38.74 
 
 
465 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  38.11 
 
 
461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  40.45 
 
 
451 aa  318  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  39.24 
 
 
466 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  37.67 
 
 
461 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  40.68 
 
 
466 aa  317  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  37.89 
 
 
464 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  37.61 
 
 
480 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  37.39 
 
 
480 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  37.89 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  37.89 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  37.39 
 
 
480 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  36.98 
 
 
477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  40.45 
 
 
458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  38.6 
 
 
465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  36.76 
 
 
477 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>