More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_48850 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  73.03 
 
 
452 aa  685    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  74.11 
 
 
453 aa  708    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  75.06 
 
 
455 aa  725    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  75.33 
 
 
454 aa  728    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  76.92 
 
 
457 aa  740    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  74.01 
 
 
454 aa  717    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  74.33 
 
 
453 aa  709    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  72.36 
 
 
452 aa  681    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  74.78 
 
 
453 aa  716    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  76.72 
 
 
455 aa  731    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  72.81 
 
 
452 aa  689    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  74.55 
 
 
453 aa  711    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  77.7 
 
 
456 aa  753    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  100 
 
 
457 aa  932    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  77.7 
 
 
456 aa  753    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  65.69 
 
 
460 aa  614  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  64.24 
 
 
466 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  62.9 
 
 
451 aa  605  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  61.64 
 
 
470 aa  586  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  59.15 
 
 
471 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  58.8 
 
 
459 aa  559  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  59.24 
 
 
461 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  59.87 
 
 
465 aa  553  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  59.24 
 
 
461 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  59.24 
 
 
464 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  55.13 
 
 
460 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  58.57 
 
 
481 aa  551  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  58.42 
 
 
478 aa  548  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  57.68 
 
 
482 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  58.35 
 
 
464 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  57.72 
 
 
478 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  58.57 
 
 
465 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  58.35 
 
 
464 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  58.35 
 
 
461 aa  544  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  58.71 
 
 
480 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  59.28 
 
 
455 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  58.71 
 
 
480 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  58.93 
 
 
480 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  59.28 
 
 
455 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  58.71 
 
 
480 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  57.75 
 
 
472 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  57.75 
 
 
472 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  58.15 
 
 
475 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  58.35 
 
 
477 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  59.02 
 
 
464 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  59.72 
 
 
456 aa  540  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  57.75 
 
 
472 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  58.35 
 
 
477 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  58.85 
 
 
466 aa  537  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  57.53 
 
 
475 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  57.53 
 
 
475 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  57.53 
 
 
472 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  57.75 
 
 
477 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  57.75 
 
 
476 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  56.07 
 
 
460 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  55.63 
 
 
460 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  57.08 
 
 
478 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2871  putative aminotransferase  54.63 
 
 
460 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  56.95 
 
 
465 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  57.81 
 
 
465 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  55.11 
 
 
463 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4932  putative aminotransferase  53.76 
 
 
456 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  54.04 
 
 
458 aa  497  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3250  putative aminotransferase  55.16 
 
 
460 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2588  putative aminotransferase  54.93 
 
 
460 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155274  normal  0.308476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3128  putative aminotransferase  54.93 
 
 
460 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  45.08 
 
 
456 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  43.57 
 
 
456 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  42.35 
 
 
456 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  42.38 
 
 
459 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  45.31 
 
 
458 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  44.83 
 
 
460 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  45.31 
 
 
485 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  41.83 
 
 
463 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  44.91 
 
 
460 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  45.92 
 
 
468 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  43.33 
 
 
461 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  45.54 
 
 
463 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  41.46 
 
 
456 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  42.92 
 
 
455 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  42.05 
 
 
456 aa  368  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  44.66 
 
 
449 aa  364  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  44.89 
 
 
468 aa  361  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  43.33 
 
 
465 aa  358  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  44.35 
 
 
462 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  45.31 
 
 
463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  42.5 
 
 
458 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  42.26 
 
 
460 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  42.7 
 
 
460 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  43.86 
 
 
458 aa  355  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2912  hypothetical protein  46.59 
 
 
457 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  45.52 
 
 
459 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  43.86 
 
 
457 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  42.56 
 
 
456 aa  353  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  42.99 
 
 
469 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  42.53 
 
 
466 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  42.49 
 
 
461 aa  352  8e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  41.35 
 
 
467 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  41.46 
 
 
468 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  39.73 
 
 
467 aa  350  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>