More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0281 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  84.55 
 
 		 452 aa  808    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  74.78 
 
 		 457 aa  716    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  95.36 
 
 		 453 aa  899    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  82.89 
 
 		 455 aa  810    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  100 
 
 		 453 aa  929    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  84.11 
 
 		 452 aa  803    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  82.78 
 
 		 454 aa  814    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  81.15 
 
 		 455 aa  773    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  84.11 
 
 		 454 aa  814    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  95.14 
 
 		 453 aa  897    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  85.43 
 
 		 452 aa  812    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  82.41 
 
 		 457 aa  776    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  66.44 
 
 		 466 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  95.81 
 
 		 453 aa  900    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  77.61 
 
 		 456 aa  756    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  77.61 
 
 		 456 aa  756    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  65.53 
 
 		 451 aa  620  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  65.24 
 
 		 460 aa  609  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  60.22 
 
 		 459 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  60.9 
 
 		 478 aa  571  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  59.51 
 
 		 470 aa  566  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  58.57 
 
 		 481 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  58.04 
 
 		 482 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  57.4 
 
 		 478 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  58.8 
 
 		 471 aa  554  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  60.32 
 
 		 465 aa  554  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  57.58 
 
 		 455 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  57.46 
 
 		 464 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  56.67 
 
 		 461 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  58.24 
 
 		 455 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  57.8 
 
 		 456 aa  547  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  57.02 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  56.25 
 
 		 477 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  56.25 
 
 		 476 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  56.44 
 
 		 461 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  55.8 
 
 		 460 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  57.02 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  57.02 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  56.12 
 
 		 461 aa  541  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  56.05 
 
 		 472 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  56.05 
 
 		 472 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  56.05 
 
 		 472 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  56.67 
 
 		 465 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  55.83 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  55.83 
 
 		 472 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  55.83 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  56.47 
 
 		 480 aa  538  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  56.98 
 
 		 480 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  56.17 
 
 		 475 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  57.21 
 
 		 480 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  56.47 
 
 		 477 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  56.85 
 
 		 477 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  56.98 
 
 		 480 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  57.17 
 
 		 478 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  55.38 
 
 		 466 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  57.4 
 
 		 465 aa  508  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  52.1 
 
 		 460 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  54.36 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  51.88 
 
 		 460 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  56.57 
 
 		 465 aa  501  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2871  putative aminotransferase  51.21 
 
 		 460 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  52.9 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2588  putative aminotransferase  52.13 
 
 		 460 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155274  normal  0.308476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4932  putative aminotransferase  51.9 
 
 		 456 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3128  putative aminotransferase  52.13 
 
 		 460 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3250  putative aminotransferase  52.36 
 
 		 460 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  45.16 
 
 		 456 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  43.28 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  44.23 
 
 		 460 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  43.22 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  43.36 
 
 		 460 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  45.37 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  43.83 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  43.61 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  42.89 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  44.02 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  42.89 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  44.29 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  42.41 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  44.32 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  41.61 
 
 		 459 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  43.61 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  44.06 
 
 		 455 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  44.03 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  43.79 
 
 		 468 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  42.18 
 
 		 456 aa  363  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  42.42 
 
 		 468 aa  363  4e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  41.76 
 
 		 461 aa  359  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  40.09 
 
 		 461 aa  355  8.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  42.89 
 
 		 451 aa  351  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  41.13 
 
 		 467 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  42.38 
 
 		 443 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  44.2 
 
 		 459 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2912  hypothetical protein  44.02 
 
 		 457 aa  350  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  41.78 
 
 		 465 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  40.13 
 
 		 459 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  42.23 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  40.96 
 
 		 467 aa  346  5e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  41.27 
 
 		 456 aa  345  8e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  41.23 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>