More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2871 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2588  putative aminotransferase  93.91 
 
 		 460 aa  855    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155274  normal  0.308476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3250  putative aminotransferase  94.13 
 
 		 460 aa  856    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4932  putative aminotransferase  83.85 
 
 		 456 aa  761    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  69.96 
 
 		 463 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  84.57 
 
 		 460 aa  805    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3128  putative aminotransferase  93.91 
 
 		 460 aa  855    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2871  putative aminotransferase  100 
 
 		 460 aa  949    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  84.78 
 
 		 460 aa  832    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  58.9 
 
 		 478 aa  557  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  58.94 
 
 		 482 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  59.07 
 
 		 480 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  59.03 
 
 		 477 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  58.94 
 
 		 481 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  58.81 
 
 		 477 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  58.59 
 
 		 480 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  58.59 
 
 		 480 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  58.59 
 
 		 480 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  57.8 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  57.62 
 
 		 477 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  57.49 
 
 		 476 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  58.59 
 
 		 475 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  57.8 
 
 		 464 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  57.8 
 
 		 464 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  58.31 
 
 		 461 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  56.83 
 
 		 472 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  56.61 
 
 		 472 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  57.14 
 
 		 461 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  58.09 
 
 		 461 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  56.39 
 
 		 475 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  56.39 
 
 		 472 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  56.39 
 
 		 475 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  56.61 
 
 		 472 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  54.37 
 
 		 455 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  57.68 
 
 		 465 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  54.5 
 
 		 455 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  54.63 
 
 		 457 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  53.67 
 
 		 454 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  54.22 
 
 		 457 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  51.21 
 
 		 453 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  52.37 
 
 		 452 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  51.21 
 
 		 453 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  52.14 
 
 		 452 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  52.13 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  51.21 
 
 		 453 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  51.43 
 
 		 454 aa  501  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  52.13 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  50.68 
 
 		 451 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  52.14 
 
 		 452 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  50.77 
 
 		 453 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  51.45 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  52.63 
 
 		 455 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  51.33 
 
 		 460 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  51.26 
 
 		 455 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  51.95 
 
 		 456 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  50.89 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  50.11 
 
 		 459 aa  472  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  51.32 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  49.89 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  47.38 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  46.56 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  49.02 
 
 		 478 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  46.26 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  48.22 
 
 		 465 aa  425  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  49 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  43.74 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  46.62 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  38.31 
 
 		 463 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  39.55 
 
 		 456 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  40.63 
 
 		 456 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  41.14 
 
 		 458 aa  326  5e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  40.22 
 
 		 451 aa  326  5e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  40.53 
 
 		 485 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  40.31 
 
 		 463 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  38.26 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  37.55 
 
 		 470 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  38.16 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  36.26 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  36.48 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  36.06 
 
 		 467 aa  316  6e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  39.2 
 
 		 460 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  38.89 
 
 		 455 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  38.03 
 
 		 451 aa  313  4.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  39.44 
 
 		 468 aa  312  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  39.64 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  36.44 
 
 		 460 aa  309  8e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  39.01 
 
 		 461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  40.64 
 
 		 462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  37.95 
 
 		 463 aa  307  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  36.22 
 
 		 460 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  38.34 
 
 		 449 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  37.95 
 
 		 449 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  37.47 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  36.44 
 
 		 456 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  40.31 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  36.22 
 
 		 456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  36.67 
 
 		 468 aa  302  9e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  37.92 
 
 		 456 aa  299  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  37.89 
 
 		 467 aa  299  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  37.59 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  39.14 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>