More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0379 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  100 
 
 
443 aa  913    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  45.78 
 
 
451 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  42.76 
 
 
454 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  42.95 
 
 
458 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  42.54 
 
 
450 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  44.1 
 
 
451 aa  368  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  43.05 
 
 
449 aa  360  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  43.81 
 
 
460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  43.27 
 
 
466 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  43.11 
 
 
466 aa  352  8e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  42.38 
 
 
453 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  43.05 
 
 
451 aa  347  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  42.57 
 
 
457 aa  346  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  41.74 
 
 
455 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  40.97 
 
 
453 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  41.25 
 
 
454 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  41.48 
 
 
453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  41.63 
 
 
454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  41.48 
 
 
453 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  40.31 
 
 
463 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  40.72 
 
 
460 aa  342  8e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  41.26 
 
 
456 aa  342  9e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  41.26 
 
 
456 aa  342  9e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  41.06 
 
 
452 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  38.77 
 
 
452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  40.84 
 
 
452 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  40.22 
 
 
456 aa  336  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  40.49 
 
 
455 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  39.47 
 
 
457 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  40.4 
 
 
452 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  39.04 
 
 
467 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  39.57 
 
 
463 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  39.78 
 
 
471 aa  332  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  39.25 
 
 
459 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  39.34 
 
 
456 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  38.13 
 
 
463 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  37.37 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  39.04 
 
 
470 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  41.16 
 
 
460 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  38.95 
 
 
459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  38.6 
 
 
470 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  41.76 
 
 
465 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  38.85 
 
 
470 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  40.72 
 
 
460 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  39.37 
 
 
455 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  39.2 
 
 
456 aa  322  9.000000000000001e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  38.98 
 
 
456 aa  320  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  38.94 
 
 
478 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  37.67 
 
 
467 aa  320  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  39.42 
 
 
456 aa  319  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  38.08 
 
 
459 aa  319  7e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  38.84 
 
 
454 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  39.28 
 
 
464 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  39.41 
 
 
460 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  36.03 
 
 
457 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0052  hypothetical protein  37.36 
 
 
461 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  39.05 
 
 
464 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  39.05 
 
 
464 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  38.58 
 
 
461 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  36.34 
 
 
465 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  39.24 
 
 
464 aa  316  6e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  38.51 
 
 
455 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  39.78 
 
 
460 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  38.36 
 
 
461 aa  315  9e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  36.34 
 
 
466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  41.65 
 
 
450 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  39.26 
 
 
456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  37.83 
 
 
452 aa  312  5.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  39.82 
 
 
463 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  39.73 
 
 
468 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  38.36 
 
 
465 aa  312  7.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  39.81 
 
 
459 aa  311  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  38.64 
 
 
465 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  37.86 
 
 
480 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  37.64 
 
 
480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  39.01 
 
 
475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  38.63 
 
 
461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  37.64 
 
 
480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  36.46 
 
 
467 aa  310  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  36.42 
 
 
457 aa  310  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  38.63 
 
 
461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  38.63 
 
 
461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  35.98 
 
 
458 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  37.74 
 
 
477 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  36.8 
 
 
468 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  37.58 
 
 
477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  38.58 
 
 
485 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  38.07 
 
 
480 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  40.14 
 
 
456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  38.64 
 
 
455 aa  306  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  34.88 
 
 
469 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  35.25 
 
 
466 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  38.37 
 
 
461 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  37.66 
 
 
478 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  38.57 
 
 
448 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  39.2 
 
 
448 aa  306  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  38.57 
 
 
448 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  37.44 
 
 
446 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  35.02 
 
 
466 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  39.28 
 
 
460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>