More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3814 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  80.74 
 
 		 463 aa  770    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  80.87 
 
 		 463 aa  760    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  80.87 
 
 		 462 aa  746    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  80.31 
 
 		 485 aa  768    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  92.61 
 
 		 460 aa  879    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  100 
 
 		 460 aa  935    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  58.95 
 
 		 461 aa  567  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  55.85 
 
 		 456 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  55.26 
 
 		 455 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  53.73 
 
 		 461 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  54.07 
 
 		 456 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  51.21 
 
 		 459 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  52.73 
 
 		 456 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  50.45 
 
 		 456 aa  465  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  50.9 
 
 		 456 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  51.13 
 
 		 456 aa  463  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  50.78 
 
 		 463 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  52.29 
 
 		 468 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  51.88 
 
 		 460 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  51.64 
 
 		 460 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  47.35 
 
 		 450 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  52.69 
 
 		 458 aa  451  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  49.23 
 
 		 459 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  48.11 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  48.78 
 
 		 449 aa  428  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  47.88 
 
 		 450 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  44.23 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  45.03 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  43.57 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  43.79 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  43.57 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  43.36 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  45.98 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  44.44 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  45.29 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  44.4 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  43.17 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  44.52 
 
 		 455 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  44.91 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  43.3 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2033  aminotransferase class-III  43.21 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0857  aminotransferase class-III  44.37 
 
 		 455 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  44.93 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  43.3 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  41.94 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0379  aminotransferase  42.99 
 
 		 455 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.996959  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  45.84 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4250  aminotransferase  44.24 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.533724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  43.05 
 
 		 463 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  41.79 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  42.14 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  42.95 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  43.64 
 
 		 452 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  45.84 
 
 		 451 aa  364  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3984  aminotransferase class-III  42.3 
 
 		 453 aa  364  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319262  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  42.26 
 
 		 460 aa  363  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  41.03 
 
 		 468 aa  362  6e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  42.95 
 
 		 452 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  43.32 
 
 		 464 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  43.32 
 
 		 464 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  43.61 
 
 		 464 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  43.83 
 
 		 464 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  43.1 
 
 		 464 aa  359  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  42.95 
 
 		 452 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  43.39 
 
 		 464 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  41.94 
 
 		 465 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  42.73 
 
 		 456 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  41.63 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  42.38 
 
 		 455 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  40.93 
 
 		 457 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  43.79 
 
 		 459 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  40.3 
 
 		 469 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  40.4 
 
 		 457 aa  346  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  42.38 
 
 		 455 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  39.87 
 
 		 465 aa  345  8e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  40.84 
 
 		 456 aa  345  8.999999999999999e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  41.23 
 
 		 457 aa  343  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  41.63 
 
 		 470 aa  342  5.999999999999999e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  41.2 
 
 		 465 aa  342  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  40.39 
 
 		 458 aa  338  8e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9130  aminotransferase  40.05 
 
 		 463 aa  335  7e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1121  aminotransferase  40.87 
 
 		 453 aa  335  7.999999999999999e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.713073  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  39.96 
 
 		 459 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  41.27 
 
 		 478 aa  334  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  39.38 
 
 		 457 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  40.57 
 
 		 478 aa  330  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  39.6 
 
 		 461 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  39.73 
 
 		 459 aa  329  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  39.41 
 
 		 466 aa  329  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  41.52 
 
 		 465 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  42.02 
 
 		 465 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  41.31 
 
 		 464 aa  326  6e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  39.15 
 
 		 461 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  39.24 
 
 		 464 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  39.24 
 
 		 464 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  40.45 
 
 		 469 aa  325  9e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  40.54 
 
 		 467 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  39.46 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  40.72 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  40.53 
 
 		 460 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0755258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>