More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3704 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  77.85 
 
 		 457 aa  762    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  90.57 
 
 		 459 aa  870    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  90.79 
 
 		 459 aa  874    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  64.35 
 
 		 460 aa  639    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  68.86 
 
 		 456 aa  675    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  942    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  70.68 
 
 		 457 aa  686    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  85.53 
 
 		 457 aa  838    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  83.77 
 
 		 457 aa  818    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  60.92 
 
 		 468 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  60.61 
 
 		 468 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  60.22 
 
 		 465 aa  581  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  59.11 
 
 		 469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  58.94 
 
 		 465 aa  566  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  59.39 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  59.17 
 
 		 464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  59.17 
 
 		 464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  59.39 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  59.39 
 
 		 464 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  60.76 
 
 		 459 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  59.39 
 
 		 464 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  54.1 
 
 		 463 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  52.17 
 
 		 467 aa  492  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  52.08 
 
 		 463 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  51.85 
 
 		 467 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  45.58 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  47.79 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  45.41 
 
 		 456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  44.4 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  44.57 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  44.62 
 
 		 456 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  44.84 
 
 		 456 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  44.19 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  44.65 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  43.74 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  43.58 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  41.28 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  44.02 
 
 		 458 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  42.73 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  42.13 
 
 		 466 aa  361  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  44.15 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  43.12 
 
 		 460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  42.66 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  41.96 
 
 		 459 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  41.15 
 
 		 463 aa  349  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  42.98 
 
 		 454 aa  349  6e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  40.93 
 
 		 485 aa  348  8e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  43.46 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  39.39 
 
 		 460 aa  340  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  40.39 
 
 		 460 aa  338  8e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  40.66 
 
 		 453 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  40.7 
 
 		 450 aa  338  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  38.16 
 
 		 459 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  40.5 
 
 		 458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  42.06 
 
 		 453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  40.53 
 
 		 456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  40.53 
 
 		 456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  42.06 
 
 		 453 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  40.44 
 
 		 449 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  41.14 
 
 		 455 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  41.16 
 
 		 454 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  40 
 
 		 452 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  40 
 
 		 452 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  40.35 
 
 		 466 aa  332  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  38.7 
 
 		 451 aa  332  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  40.31 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  40 
 
 		 452 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  40.4 
 
 		 456 aa  330  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  42.55 
 
 		 457 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  41.49 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  41.77 
 
 		 457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  35.82 
 
 		 467 aa  328  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  39.74 
 
 		 462 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  40.79 
 
 		 450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  40.22 
 
 		 469 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  39.65 
 
 		 466 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  40.49 
 
 		 463 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  39.65 
 
 		 466 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  40.13 
 
 		 471 aa  325  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  39.25 
 
 		 465 aa  322  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  40.32 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  38.99 
 
 		 465 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  40.26 
 
 		 451 aa  319  5e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  38.68 
 
 		 466 aa  318  9e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  38.77 
 
 		 466 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  38.77 
 
 		 466 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  38.77 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  39.56 
 
 		 458 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  39.04 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  39.25 
 
 		 457 aa  316  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  38.82 
 
 		 464 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  38.82 
 
 		 464 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  38.99 
 
 		 465 aa  316  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  39.74 
 
 		 465 aa  316  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  39.07 
 
 		 480 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  39.29 
 
 		 481 aa  315  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  39.07 
 
 		 480 aa  315  9e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  39.07 
 
 		 480 aa  315  9e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  38.82 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  38.82 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>