More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0797 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  100 
 
 		 461 aa  949    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  58.55 
 
 		 485 aa  578  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  58.95 
 
 		 460 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  58.77 
 
 		 463 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  58.95 
 
 		 460 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  57.86 
 
 		 463 aa  561  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  60.59 
 
 		 456 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  57.64 
 
 		 462 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  58.11 
 
 		 455 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  56.63 
 
 		 456 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  56.59 
 
 		 461 aa  521  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  56.14 
 
 		 456 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  51.32 
 
 		 459 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  55.06 
 
 		 458 aa  503  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  52.57 
 
 		 456 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  52.13 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  52.35 
 
 		 456 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  51.66 
 
 		 450 aa  488  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  49.89 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  51.45 
 
 		 459 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  48.91 
 
 		 460 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  48.47 
 
 		 460 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  49.56 
 
 		 468 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  51.25 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  49.89 
 
 		 450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  47.22 
 
 		 463 aa  439  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  47.03 
 
 		 467 aa  435  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  45.77 
 
 		 467 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  46.34 
 
 		 463 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  46.21 
 
 		 463 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  46.61 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  46.61 
 
 		 464 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  46.61 
 
 		 464 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  46.38 
 
 		 464 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4250  aminotransferase  43.99 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.533724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  43.69 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  45.7 
 
 		 464 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  46.38 
 
 		 464 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  45.09 
 
 		 468 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2033  aminotransferase class-III  43.75 
 
 		 455 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0379  aminotransferase  43.75 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.996959  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9130  aminotransferase  41.79 
 
 		 463 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  43.56 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  43.27 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  42.13 
 
 		 465 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  42.79 
 
 		 457 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3984  aminotransferase class-III  42.3 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319262  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  43.48 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0857  aminotransferase class-III  42.3 
 
 		 455 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  43.24 
 
 		 465 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  41.89 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  42.73 
 
 		 458 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  42.83 
 
 		 468 aa  375  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  41.87 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  42.29 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  43.58 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  41.59 
 
 		 460 aa  372  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  42.29 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  42.57 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  43.22 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  41.67 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  43.19 
 
 		 455 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  41.59 
 
 		 455 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  41.07 
 
 		 460 aa  362  6e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  41.56 
 
 		 459 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  42.26 
 
 		 457 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  40.31 
 
 		 453 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  40.97 
 
 		 454 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  42.26 
 
 		 457 aa  356  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1121  aminotransferase  40.76 
 
 		 453 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.713073  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  40.31 
 
 		 453 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  39.96 
 
 		 460 aa  352  5.9999999999999994e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  42.15 
 
 		 455 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  40.31 
 
 		 453 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  38.75 
 
 		 466 aa  352  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  38.94 
 
 		 467 aa  351  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  40.09 
 
 		 453 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  41.86 
 
 		 451 aa  351  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  38.86 
 
 		 459 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  42.03 
 
 		 452 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  41.34 
 
 		 452 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  38.43 
 
 		 457 aa  345  7e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  42.03 
 
 		 452 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  41.26 
 
 		 455 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  40.05 
 
 		 451 aa  342  9e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  39.96 
 
 		 456 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  39.51 
 
 		 471 aa  341  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  39.32 
 
 		 467 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  41.01 
 
 		 464 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  38.23 
 
 		 478 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  37.5 
 
 		 466 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  37.27 
 
 		 466 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  40.63 
 
 		 465 aa  328  9e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  38.15 
 
 		 470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  37.73 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  37.5 
 
 		 466 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  39.65 
 
 		 478 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  37.5 
 
 		 466 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  38.01 
 
 		 465 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  37.95 
 
 		 465 aa  326  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>