More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1491 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  65.27 
 
 		 459 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  100 
 
 		 463 aa  953    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  61.62 
 
 		 460 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  61.62 
 
 		 460 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  62.28 
 
 		 468 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  57.01 
 
 		 456 aa  545  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  57.37 
 
 		 459 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  56.03 
 
 		 456 aa  528  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  56.25 
 
 		 456 aa  530  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  54.34 
 
 		 456 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  53.44 
 
 		 456 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  52.69 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  51.9 
 
 		 455 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  52.57 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  49.89 
 
 		 461 aa  475  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  50.87 
 
 		 485 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  50.11 
 
 		 461 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  51.22 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  50.78 
 
 		 460 aa  461  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  50.92 
 
 		 456 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  49.89 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  52.12 
 
 		 463 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  51.22 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  47.35 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  46.56 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  45.58 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  45.31 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  44.84 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  44.64 
 
 		 467 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  45.13 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  44.69 
 
 		 459 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  44.64 
 
 		 457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  43.95 
 
 		 463 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  44.25 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  43.75 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  43.61 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  45.76 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  45.98 
 
 		 464 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  43.3 
 
 		 469 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  45.98 
 
 		 464 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  45.76 
 
 		 464 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  47.1 
 
 		 464 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  46.88 
 
 		 464 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  44.59 
 
 		 456 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  43.15 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  44.22 
 
 		 468 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  42.32 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  44.42 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  44.42 
 
 		 457 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  41.87 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  43.33 
 
 		 455 aa  385  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  41.87 
 
 		 468 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  42.48 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  43.31 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  41.83 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  42.58 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  42.2 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  42.32 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  42.32 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  43.21 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  41.83 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0857  aminotransferase class-III  43.59 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  42.41 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  42.82 
 
 		 466 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  41.96 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  40.98 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0379  aminotransferase  42.3 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.996959  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2033  aminotransferase class-III  42.07 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  39.65 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  41.96 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  41.41 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  40.57 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  41.96 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  41.37 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3984  aminotransferase class-III  42.13 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319262  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  44.62 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4250  aminotransferase  41.4 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.533724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  42.28 
 
 		 466 aa  363  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  41.91 
 
 		 466 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  41.89 
 
 		 466 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  43.02 
 
 		 467 aa  362  8e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  43.21 
 
 		 451 aa  362  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  42.13 
 
 		 480 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  41.91 
 
 		 480 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  41.91 
 
 		 480 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  41.91 
 
 		 466 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  40.62 
 
 		 455 aa  359  6e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  43.69 
 
 		 449 aa  359  6e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  41.91 
 
 		 480 aa  358  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  41.19 
 
 		 458 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0052  hypothetical protein  41.26 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  42.12 
 
 		 466 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  41.43 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  42.12 
 
 		 466 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  42.67 
 
 		 465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  39.22 
 
 		 470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  41.69 
 
 		 477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  42.05 
 
 		 452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  40.36 
 
 		 454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  40.89 
 
 		 452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>