More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0061 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  81.09 
 
 		 464 aa  762    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  81.21 
 
 		 464 aa  765    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  75.62 
 
 		 459 aa  709    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  88.6 
 
 		 469 aa  861    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  80.65 
 
 		 464 aa  762    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  82.47 
 
 		 465 aa  801    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  957    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  80.65 
 
 		 464 aa  762    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  80.87 
 
 		 464 aa  762    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  80.87 
 
 		 464 aa  761    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  62.09 
 
 		 468 aa  614  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  63.82 
 
 		 468 aa  600  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  61.1 
 
 		 457 aa  592  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  59.17 
 
 		 459 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  60.22 
 
 		 458 aa  581  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  59.18 
 
 		 467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  60 
 
 		 457 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  59.03 
 
 		 457 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  58.81 
 
 		 459 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  59.78 
 
 		 457 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  58.15 
 
 		 456 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  58.08 
 
 		 467 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  58.52 
 
 		 460 aa  554  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  58.54 
 
 		 463 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  58.06 
 
 		 463 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  44.02 
 
 		 456 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  44.2 
 
 		 456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  43.75 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  44.2 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  44.3 
 
 		 455 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  44.2 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  45.87 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  42.45 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  43.14 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  43.05 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  41.05 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  43.02 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  42.38 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  42.53 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  40.22 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  43.28 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  43.24 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  42.13 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  42.13 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  43.24 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  41.99 
 
 		 458 aa  363  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  43.36 
 
 		 451 aa  363  3e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  42.6 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  43.47 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  42.89 
 
 		 450 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  42.99 
 
 		 460 aa  358  8e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  42.99 
 
 		 457 aa  358  9e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  43.33 
 
 		 457 aa  358  9e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  42.99 
 
 		 450 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  43.21 
 
 		 465 aa  356  5.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  41.94 
 
 		 460 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  40.97 
 
 		 463 aa  354  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  43.17 
 
 		 451 aa  355  1e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  40.57 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 456 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  41.31 
 
 		 455 aa  353  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  41.96 
 
 		 455 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  41.55 
 
 		 454 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  42.02 
 
 		 453 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  38.65 
 
 		 451 aa  348  8e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  41.55 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  41.61 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  41.55 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  40.96 
 
 		 470 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  40.22 
 
 		 471 aa  346  6e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  42.7 
 
 		 462 aa  346  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  41.81 
 
 		 454 aa  345  8e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  41.18 
 
 		 470 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  43.66 
 
 		 452 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  42.72 
 
 		 452 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  39.82 
 
 		 449 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  38.5 
 
 		 463 aa  341  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  43.19 
 
 		 452 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  40.41 
 
 		 455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  40.35 
 
 		 468 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  38.14 
 
 		 467 aa  338  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  42.73 
 
 		 465 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  41.61 
 
 		 463 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  38.84 
 
 		 466 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  40.9 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  40 
 
 		 482 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  42.22 
 
 		 466 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  38.14 
 
 		 458 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  38.62 
 
 		 466 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  40 
 
 		 466 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  39.02 
 
 		 466 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  39.02 
 
 		 466 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  39.02 
 
 		 466 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  40.49 
 
 		 478 aa  330  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  40.04 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  39.87 
 
 		 449 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  37.97 
 
 		 459 aa  329  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  40.04 
 
 		 461 aa  329  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  39.42 
 
 		 469 aa  328  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.475128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>