More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6348 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  72.33 
 
 		 467 aa  663    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  79.3 
 
 		 465 aa  719    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  96.14 
 
 		 466 aa  904    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  98.71 
 
 		 466 aa  924    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  96.57 
 
 		 466 aa  907    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  66.45 
 
 		 459 aa  646    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0052  hypothetical protein  69.15 
 
 		 461 aa  655    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  79.3 
 
 		 465 aa  717    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  78.74 
 
 		 466 aa  744    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  96.14 
 
 		 466 aa  904    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  78.31 
 
 		 469 aa  709    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  935    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2181  hypothetical protein  68.42 
 
 		 467 aa  622  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  65.48 
 
 		 466 aa  613  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  59.68 
 
 		 458 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  61.14 
 
 		 457 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  59.69 
 
 		 458 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  62.81 
 
 		 452 aa  544  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4413  hypothetical protein  60.26 
 
 		 458 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2912  hypothetical protein  62.88 
 
 		 457 aa  538  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5008  hypothetical protein  60.87 
 
 		 458 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375016 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4964  hypothetical protein  60 
 
 		 458 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0693089  normal  0.0526808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1920  hypothetical protein  60.35 
 
 		 458 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  42.63 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  42.99 
 
 		 455 aa  363  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  41.91 
 
 		 463 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  42.73 
 
 		 456 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  42.32 
 
 		 457 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  42.19 
 
 		 470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  42.13 
 
 		 456 aa  353  4e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  40.31 
 
 		 459 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  41.83 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  42.76 
 
 		 457 aa  348  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  41.54 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  41.54 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  41.32 
 
 		 464 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  41.32 
 
 		 464 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  41.54 
 
 		 464 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  41.54 
 
 		 464 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  41.23 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  40.62 
 
 		 459 aa  343  4e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  41 
 
 		 453 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  41 
 
 		 453 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  41.04 
 
 		 455 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  41 
 
 		 453 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  40.55 
 
 		 454 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  41.45 
 
 		 457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  41.76 
 
 		 457 aa  339  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  40.72 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  40.72 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  42.32 
 
 		 458 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  40.36 
 
 		 454 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  40.09 
 
 		 460 aa  335  7.999999999999999e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  38.08 
 
 		 451 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  42.08 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 452 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  38.62 
 
 		 465 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  41.32 
 
 		 452 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  38.62 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  40 
 
 		 465 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  41.78 
 
 		 452 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  39.6 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  41.03 
 
 		 457 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  38.56 
 
 		 471 aa  330  3e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  39.02 
 
 		 469 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  40.04 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  40.22 
 
 		 459 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  39.65 
 
 		 458 aa  326  6e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  40.5 
 
 		 463 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  39.46 
 
 		 470 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  37.27 
 
 		 461 aa  322  6e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  39.6 
 
 		 459 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  39.05 
 
 		 459 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  41.93 
 
 		 457 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  39.86 
 
 		 468 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  36.28 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  37.89 
 
 		 468 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  40.09 
 
 		 460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  40.18 
 
 		 485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  40.39 
 
 		 456 aa  320  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  37.95 
 
 		 465 aa  320  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  38.57 
 
 		 470 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  38.94 
 
 		 460 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  40.09 
 
 		 460 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  38.03 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  38.34 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  40.05 
 
 		 456 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  38.15 
 
 		 465 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  40 
 
 		 463 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  36.15 
 
 		 467 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  39.86 
 
 		 460 aa  316  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  41.63 
 
 		 455 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  38.93 
 
 		 466 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  38.22 
 
 		 468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  41.18 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  40.18 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  38.65 
 
 		 456 aa  309  8e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2091  hypothetical protein  40 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  38.43 
 
 		 456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  35.02 
 
 		 443 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>