More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4413 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1920  hypothetical protein  81.4 
 
 		 458 aa  709    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5008  hypothetical protein  87.53 
 
 		 458 aa  813    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375016 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  81.8 
 
 		 457 aa  764    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  88.18 
 
 		 458 aa  842    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2912  hypothetical protein  82.02 
 
 		 457 aa  726    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4413  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  932    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4964  hypothetical protein  79.26 
 
 		 458 aa  707    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0693089  normal  0.0526808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  59.48 
 
 		 459 aa  564  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  60.82 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  59.65 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  60.26 
 
 		 466 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  60.04 
 
 		 466 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  60.26 
 
 		 466 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  60.26 
 
 		 466 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  60.66 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  59.83 
 
 		 465 aa  538  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0052  hypothetical protein  57.46 
 
 		 461 aa  537  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  59.96 
 
 		 465 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  58.96 
 
 		 466 aa  538  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  59.34 
 
 		 467 aa  534  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  58.48 
 
 		 452 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2181  hypothetical protein  59.34 
 
 		 467 aa  527  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  57.05 
 
 		 458 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  42.38 
 
 		 457 aa  356  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  43.12 
 
 		 457 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  41.82 
 
 		 455 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  41.86 
 
 		 453 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  41.86 
 
 		 453 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  41.86 
 
 		 453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  41.4 
 
 		 453 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  40.59 
 
 		 451 aa  337  3.9999999999999995e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  40.18 
 
 		 459 aa  336  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  38.85 
 
 		 471 aa  336  5e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  41.06 
 
 		 466 aa  335  7.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  40.13 
 
 		 460 aa  333  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  40.84 
 
 		 470 aa  332  7.000000000000001e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  41.08 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  41.72 
 
 		 452 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  40.63 
 
 		 454 aa  329  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  41.87 
 
 		 460 aa  329  7e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  38.67 
 
 		 470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  41.87 
 
 		 460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  40.59 
 
 		 458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  38.44 
 
 		 470 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  38.67 
 
 		 470 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  40.18 
 
 		 451 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  40.63 
 
 		 454 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  40.82 
 
 		 452 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  39.41 
 
 		 466 aa  325  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  38.96 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  40.09 
 
 		 456 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  41.04 
 
 		 452 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  40.09 
 
 		 456 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  38.55 
 
 		 463 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  39.6 
 
 		 455 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  41.46 
 
 		 468 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  40.35 
 
 		 465 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  38.39 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  38.68 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  39.46 
 
 		 459 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  38.56 
 
 		 460 aa  317  3e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  37.78 
 
 		 469 aa  316  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  35.76 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  40.3 
 
 		 463 aa  315  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  38.93 
 
 		 451 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  39.56 
 
 		 457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  40.18 
 
 		 454 aa  313  4.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  40.09 
 
 		 458 aa  313  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  37.11 
 
 		 465 aa  312  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  39.21 
 
 		 456 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  38.9 
 
 		 450 aa  310  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  36.73 
 
 		 468 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  38.37 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  38.07 
 
 		 459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  39.3 
 
 		 457 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  37.19 
 
 		 456 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  37.72 
 
 		 457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  36.91 
 
 		 468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  37.69 
 
 		 467 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  38.69 
 
 		 465 aa  303  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  37.86 
 
 		 459 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  38.53 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  38.96 
 
 		 461 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  39.1 
 
 		 465 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  38.19 
 
 		 478 aa  300  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  38.31 
 
 		 456 aa  299  6e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  37.33 
 
 		 464 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  38.05 
 
 		 468 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  36.32 
 
 		 460 aa  297  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  37.3 
 
 		 449 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  36.22 
 
 		 465 aa  296  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  37.33 
 
 		 464 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  38.29 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  38.01 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  38.29 
 
 		 464 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  37.16 
 
 		 463 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  38.46 
 
 		 458 aa  294  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  37.11 
 
 		 450 aa  293  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  36.87 
 
 		 464 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1166  hypothetical protein  39.46 
 
 		 452 aa  292  7e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>