More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0404 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  100 
 
 		 454 aa  929    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  75.62 
 
 		 449 aa  713    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  92.63 
 
 		 450 aa  865    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  54.83 
 
 		 452 aa  481  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  50.79 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  50.23 
 
 		 451 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  42.76 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  43.85 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  43.85 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  43.85 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  43.85 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  43.85 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  42.02 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  43.62 
 
 		 449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  44.04 
 
 		 449 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  42.66 
 
 		 456 aa  355  7.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  43.4 
 
 		 449 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  43.55 
 
 		 471 aa  351  1e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  41.11 
 
 		 460 aa  351  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  42.86 
 
 		 457 aa  350  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  42.66 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  42.63 
 
 		 446 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  42.27 
 
 		 446 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  41.83 
 
 		 459 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  41.4 
 
 		 451 aa  345  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  42.05 
 
 		 446 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  41.82 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  41.82 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  41.82 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  42.24 
 
 		 463 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  42.89 
 
 		 455 aa  342  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  43.84 
 
 		 454 aa  341  1e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  40.89 
 
 		 460 aa  340  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  40.23 
 
 		 466 aa  341  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  42.33 
 
 		 455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  41.56 
 
 		 466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  43.31 
 
 		 460 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  43.12 
 
 		 457 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  43.31 
 
 		 460 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  41.86 
 
 		 455 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  43.58 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  43.31 
 
 		 468 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  42.6 
 
 		 448 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  40.55 
 
 		 456 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  40.55 
 
 		 456 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  39.91 
 
 		 470 aa  329  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  42.37 
 
 		 448 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  42.37 
 
 		 448 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  41.92 
 
 		 454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  41.31 
 
 		 455 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  40.09 
 
 		 454 aa  325  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  38.5 
 
 		 470 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  40.09 
 
 		 456 aa  323  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  40.47 
 
 		 456 aa  323  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  40.32 
 
 		 449 aa  322  7e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  41.4 
 
 		 454 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  42.6 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  41.75 
 
 		 448 aa  321  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  43.85 
 
 		 459 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  39.51 
 
 		 457 aa  320  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  41.18 
 
 		 454 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4437  hypothetical protein  38.15 
 
 		 451 aa  319  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691941  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  39.76 
 
 		 453 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  40.18 
 
 		 465 aa  319  7e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  41.14 
 
 		 458 aa  318  9e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  38.84 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  37.81 
 
 		 470 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  40.47 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  37.7 
 
 		 470 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  40.75 
 
 		 453 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  41.07 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  39.35 
 
 		 465 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  40.57 
 
 		 465 aa  317  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  41.46 
 
 		 465 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  40.75 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  40.6 
 
 		 478 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  39.37 
 
 		 457 aa  316  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  40.88 
 
 		 458 aa  315  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  40.38 
 
 		 452 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  42.33 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  39.69 
 
 		 464 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  41.98 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  38.85 
 
 		 449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1166  hypothetical protein  38.79 
 
 		 452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  38.85 
 
 		 449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  42.56 
 
 		 485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  38.85 
 
 		 450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  38.79 
 
 		 459 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5008  hypothetical protein  40.88 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375016 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  38.85 
 
 		 450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  38.63 
 
 		 449 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  42.69 
 
 		 462 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  39 
 
 		 475 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  38.63 
 
 		 449 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  39.87 
 
 		 450 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  38.41 
 
 		 450 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  39.9 
 
 		 452 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  40.78 
 
 		 459 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  38.93 
 
 		 457 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  39.64 
 
 		 459 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>