More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1166 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1166  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  930    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41749  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4437  hypothetical protein  81.74 
 
 
451 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691941  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3718  hypothetical protein  67.79 
 
 
455 aa  622  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.072939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3512  hypothetical protein  65.85 
 
 
447 aa  601  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000425245  hitchhiker  0.000284968 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  56.82 
 
 
448 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  52.05 
 
 
449 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  51.36 
 
 
449 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  51.36 
 
 
449 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  51.59 
 
 
449 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  51.36 
 
 
449 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  51.36 
 
 
449 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  51.36 
 
 
449 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  51.59 
 
 
449 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  51.7 
 
 
446 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  51.25 
 
 
446 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  51.25 
 
 
446 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  51.25 
 
 
446 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  51.59 
 
 
446 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  51.25 
 
 
446 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  51.36 
 
 
446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  47.1 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  45.72 
 
 
456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  47.1 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  47.1 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  44.44 
 
 
454 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  44.22 
 
 
454 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  38.79 
 
 
454 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  39.51 
 
 
450 aa  319  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  39.73 
 
 
449 aa  317  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  37.98 
 
 
459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  38.24 
 
 
451 aa  306  5.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  39.96 
 
 
458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  39.02 
 
 
451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  39.41 
 
 
466 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  39.41 
 
 
466 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  39.29 
 
 
466 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  38.85 
 
 
466 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  38.96 
 
 
466 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  39.05 
 
 
452 aa  299  5e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  37.36 
 
 
455 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  37.22 
 
 
454 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2091  hypothetical protein  38.96 
 
 
473 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  37.99 
 
 
456 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  37.9 
 
 
465 aa  298  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  36.55 
 
 
465 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  37.09 
 
 
453 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  38.69 
 
 
458 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  39.46 
 
 
457 aa  296  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  37.16 
 
 
458 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  36.87 
 
 
453 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  36.62 
 
 
454 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4413  hypothetical protein  40.67 
 
 
458 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  38.17 
 
 
457 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2163  hypothetical protein  38.74 
 
 
473 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000327141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  36.81 
 
 
453 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1450  hypothetical protein  38.74 
 
 
473 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235478  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0847  hypothetical protein  38.74 
 
 
473 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  38.99 
 
 
464 aa  295  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  36.64 
 
 
453 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  37.41 
 
 
443 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  36.59 
 
 
466 aa  293  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  38.31 
 
 
465 aa  292  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  37 
 
 
460 aa  292  9e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  38.44 
 
 
469 aa  292  9e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  37.14 
 
 
463 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  36.96 
 
 
455 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2912  hypothetical protein  40.18 
 
 
457 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  37.18 
 
 
457 aa  289  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  35.73 
 
 
456 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  37.25 
 
 
466 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  35.54 
 
 
460 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  37.27 
 
 
456 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  37.27 
 
 
456 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  36.67 
 
 
466 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0532  hypothetical protein  38.39 
 
 
473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601876  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  34.83 
 
 
456 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  34.61 
 
 
459 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  36.38 
 
 
458 aa  286  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  37.64 
 
 
465 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  34.83 
 
 
456 aa  286  7e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5008  hypothetical protein  39.23 
 
 
458 aa  286  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.375016 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0436  hypothetical protein  38.51 
 
 
473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  36.32 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  37.39 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  37.08 
 
 
455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  36.4 
 
 
455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  37.33 
 
 
460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  35.51 
 
 
469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  36.51 
 
 
457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1858  hypothetical protein  38.29 
 
 
473 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000249145  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  37.89 
 
 
468 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  37.41 
 
 
465 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  36.38 
 
 
459 aa  282  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  36.22 
 
 
459 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  35.49 
 
 
468 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  36.53 
 
 
470 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  36.04 
 
 
459 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  34.14 
 
 
450 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  38.79 
 
 
452 aa  280  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  35.32 
 
 
449 aa  280  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>